云南农业大学学报(自然科学)2022,Vol.37Issue(6) :1064-1070.

云南栘(木衣)总DNA提取方法比较及SSR反应体系优化

Comparison of Extraction Methods of Total DNA and Optimiza-tion of SSR Reaction Systems from Docynia delavayi

张新洛 彭劲谕 王玉昌 王大玮
云南农业大学学报(自然科学)2022,Vol.37Issue(6) :1064-1070.

云南栘(木衣)总DNA提取方法比较及SSR反应体系优化

Comparison of Extraction Methods of Total DNA and Optimiza-tion of SSR Reaction Systems from Docynia delavayi

张新洛 1彭劲谕 2王玉昌 1王大玮1
扫码查看

作者信息

  • 1. 西南林业大学林学院,云南昆明650224
  • 2. 中国农业大学农学院,北京100000
  • 折叠

摘要

[目的]从云南栘(木衣)叶片中提取高质量的总DNA,并建立稳定的SSR-PCR反应体系.[方法]以云南栘(木衣)幼嫩叶片为材料,采用尿素法、改良尿素法、SDS法、CTAB法、MAGEN试剂盒法和磁珠试剂盒法提取总DNA,从中筛选提取云南栘(木衣)总DNA的最佳方法;利用L16(45)的正交设计试验优化影响云南栘(木衣)SSR-PCR 扩增体系的影响因子,建立云南栘(木衣)SSR-PCR反应体系.[结果]改良尿素法为云南栘(木衣)总DNA的最佳提取方法,提取的总DNA质量浓度、总量和A260/A280分别为382.64ng/μL、38.26μg和1.87,且琼脂糖凝胶电泳的条带清晰明亮,说明DNA完整性好、质量浓度高.优化后的SSR-PCR扩增反应体系为:模板DNA 30ng,TaqDNA 聚合酶 0.5 U,引物 1.25 μmol/L,Mg2+2.0 mmol/L,dNTPs 2.5 mmol/L,10×PCR buffer 2.5 μL,补水至25μL.[结论]改良尿素法能够从云南栘(木衣)中提取高质量的总DNA,所建立的SSR-PCR反应体系为云南栘(木衣)的遗传多样性分析和分子标记辅助育种等研究提供了技术支持.

关键词

云南栘(木衣)/DNA提取/改良尿素法/SSR体系

引用本文复制引用

基金项目

国家自然科学基金(32060350)

云南省万人计划青年拔尖人才专项(YNWR-QNBJ-2020-230)

出版年

2022
云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子:0.828
ISSN:1004-390X
被引量3
参考文献量31
段落导航相关论文