藜麦抗坏血酸过氧化物酶基因(CqAPX)家族生物信息学与表达模式分析
Genome-Wide Identification and Expression Pattern Analysis of Ascorbate Oxidase Gene Family of Quinoa(Chenopodium quinoa Willd.)
刘文莉 1陈方军 1郭善利 1陈世华2
作者信息
- 1. 烟台大学生命科学学院,山东烟台 264005
- 2. 烟台大学生命科学学院,山东烟台 264005;中藜盐地藜麦(东营)种业科技有限公司,山东东营 257300
- 折叠
摘要
为研究藜麦APX(CqAPX)基因结构和功能,利用生物信息学方法和公共数据库对CqAPX基因家族成员的理化性质、保守基序、基因结构和顺式元件以及表达谱进行分析.结果表明,CqAPX具有较高的进化保守性,可划分为4个类群.此外,CqAPX基因的启动子含有丰富的与胁迫相关的顺式作用元件,CqAPX基因在根、叶、花序和种子中组织特异性表达.干旱、盐和热胁迫处理能够显著改变CqAPX基因的表达.
Abstract
In order to explore the structure and function of quinoa APX(CqAPX)gene,bioinformatics methods and public databases are used to analyze the physicochemical properties,conserved motifs,gene structure and cis-ele-ments,and expression profiles of members of the CqAPX gene family.The results show that CqAPX has high evolu-tionary conservatism and can be divided into four taxa.In addition,the promoter of the CqAPX gene is rich in stress-related cis-acting elements,and CqAPX gene is tissue-specific expression in roots,leaves,inflorescence,and seeds.Drought,salt,and heat stress treatments can significantly alter the expression of CqAPX genes.
关键词
藜麦/抗坏血酸过氧化物酶/非生物胁迫/基因家族Key words
quinoa/ascorbate peroxidase/abiotic stress/gene family引用本文复制引用
基金项目
山东省"渤海粮仓"科技示范工程升级版计划项目(2019BHLC001)
山东省农业良种工程(2023LZGC011)
出版年
2024
国家科技期刊平台
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