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枫斗类石斛rDNA ITS区的全序列数据库及其序列分析鉴别

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目的建立枫斗类石斛的rDNA ITS区碱基全序列数据库,利用该数据库对枫斗类石斛待检种进行准确鉴别.方法对枫斗类石斛的rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序,运用CLUSTRAL,MEGA等软件以及枫斗类石斛rDNA ITS区全序列数据库对待检种rDNA ITS区进行序列分析鉴别.结果建立了21种枫斗类石斛的rDNA ITS区全序列数据库, 枫斗类石斛在该区的种间差异显著而稳定,转换和颠换总数为11~122,变异位点数为341,信息位点数为195.与外类群植物云南石仙桃间的差异较大,转换和颠换总数为131~161.枫斗类石斛居群间的差异较小,转换和颠换总数为0~6.结论利用枫斗类石斛的全序列数据库及遗传分析软件,通过对待检种rDNA ITS区进行序列测定,可以成功鉴别属于数据库中枫斗类石斛的待检种.
DATABASE ESTABLISHMENT OF THE WHOLE rDNA ITS REGION OF DENDROBIUM SPECIES OF "FENGDOU" AND AUTHENTICATION BY ANALYSIS OF THEIR SEQUENCES

丁小余、王峥涛、徐红、徐珞珊、周开亚

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中国药科大学生药学研究室,江苏,南京,210038

南京师范大学生命科学学院,江苏,南京,210097

石斛属 枫斗类石斛 rDNA ITS区全序列 DNA分子鉴别

国家自然科学基金

30171144

2002

药学学报
中国药学会 中国医学科学院药物研究所

药学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.274
ISSN:0513-4870
年,卷(期):2002.37(7)
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