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基于DNA条形码的川贝母及其近缘种的分子鉴定与亲缘关系研究

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基于ITS2与psbA-trnH条形码序列,对川贝母及其近缘种开展分子生物学鉴定与亲缘关系研究.本文在采用《中国药典》规定的PCR-RFLP鉴定方法对川贝母及其近缘种的鉴定基础上,扩增所有样品的ITS2及psbA-trnH条形码序列,对其遗传距离进行分析,构建进化树,评价ITS2及psbA-trnH条形码的鉴定效果,探讨样品的亲缘关系.结果 显示,PCR-RFLP方法仅能将样品分为非酶切组(包括平贝母、浙贝母及伊犁贝母)与酶切组(包括浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母与川贝母).进一步获得川贝母与其近缘种的ITS2与psbA-trnH序列,发现ITS2序列长度为235～239 bp,种内和种间平均遗传距离为0.001和0.022,NJ树能够将样品分为“北方贝母群”(包括平贝母与伊犁贝母)与“南方贝母群”(包括浙贝母、浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母和川贝母).后者又可细分为浙贝母与“川贝母复合群”,其中“川贝母复合群”中的贝母品种具有相近的亲缘关系.psbA-trnH序列长度为337～373 bp,种内及种间的遗传距离为0.263和0.329,NJ树未能有效聚类.说明ITS2条形码序列不仅能够对川贝母及其部分近缘种进行快速、准确地鉴定,还能够清晰不同贝母种之间的亲缘关系,这为川贝母分子标记的开发、药用植物资源的有效保护和合理开发利用提供了重要的理论依据.
Molecular identification and genetic relationship of Fritillaria cirrhosa and related species based on DNA barcode

郑辉、邓楷煜、陈安琪、付绍兵、周德、王威威、倪典墨、任瑶瑶、周嘉裕、廖海

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西南交通大学生命科学与工程学院,四川成都610031

青海绿康生物开发有限公司,青海西宁810003

阿坝州食品药品检验所,四川阿坝624000

川贝母 ITS2 psbA-trnH DNA条形码 PCR-RFLP

国家自然科学基金资助项目四川省应用基础研究项目四川省重点研发项目成都市科技技术研发项目四川省中医药管理局项目国家级大学生创新创业计划西南交通大学个性化实验

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2019

药学学报
中国药学会 中国医学科学院药物研究所

药学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.274
ISSN：0513-4870
年,卷(期)：2019.54(12)
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