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陕西关中野生商陆资源的ITS2和sbA-trnH条形码序列研究

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为探讨DNA条形码在陕西关中野生商陆资源中的鉴定作用,本研究采用通用引物ITS2和psbA-trnH对29份商陆样品DNA进行PCR扩增和测序,用Codon CodeA-ligner V3.0进行序列拼接和校对,随后进行BLAST比对鉴定分析;同时运用MEGA 6.0分析序列特征、K2P遗传距离及种内或种间变异,并构建系统进化树,评价两对引物对该区域商陆及其混伪品的鉴别能力.研究结果表明,ITS2和psbA-trnH序列的PCR扩增和测序成功率均为100％;NJ系统进化树显示ITS2和psbA-trnH序列均可明显将所有样本分别聚为商陆、垂序商陆并与其同属近源种鄂西商陆、日本商陆及两种混伪品各自聚为不同分支;ITS2序列在种间遗传距离上较psbA-trnH有一定优势.ITS2和psbA-trnH序列均可作为DNA条形码对商陆及其混伪品进行识别和鉴定,为商陆资源品种现状与分布研究及合理开发利用提供理论依据.
Use of ITS2 and psbA-trnH DNA barcode sequences of wild Phytolacca resources in Guanzhong area of Shaanxi Province

吕瑞华、冯昭、马添翼、吕蕊花、张明英、彭亮、高静、张岗

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陕西中医药大学医学技术学院,陕西咸阳712046

陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心,陕西咸阳712046

商陆 DNA条形码 ITS2 psbA-trnH 分子鉴定

陕西中医药大学科研培育项目陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发学科创新团队项目陕西中医药大学“思邈青年学者”项目2018年公共卫生服务补助奖金专项陕西省高校青年杰出人才支持计划项目；咸阳市中青年科技领军人才项目

2017PY322019-QN01141306200105财社 [2018]43号

2020

10.16438/j.0513-4870.2020-0278

药学学报
中国药学会 中国医学科学院药物研究所

药学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.274
ISSN：0513-4870
年,卷(期)：2020.55(8)
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