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基于GROMACS的分子动力学模拟的研究

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分子动力学模拟可以通过多款软件进行﹐根据需要不同可以选择不同的软件﹐但GROMACS是应用比较广泛的。生物大分子的结构动力学决定其生物学功能﹐而分子动力学模拟是研究其结构动力学的有效手段﹐因此采用GROMACS进行分子动力学计算分析从而指导进一步的实验工作。本文重点介绍了GROMACS的特点﹑基本流程以及制约因素等﹐并展望了未来的应用前景。
Molecular Dynamics Simulations Studies Based GROMACS
Molecular dynamics simulation can be carried out through a variety of software, depending on the need to choose a different software, but GROMACS is widely used. biological functions of biological macromolecules is determined by its structural dynamics, and molecular dynamics simulation is an effective means to study its structural dynamics. Therefore,GROMACS is used to carry out molecular dynamics analysis to guide the further experimental work. This review mainly introduces the characteristics, basic process and the control of GROMACS, and the prospect of future prospects.

Molecular dynamics simulationGROMACSField

江建敏、李娟、方慧生

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中国药科大学生命科学与技术学院﹐江苏 南京 210009

南京鼓楼医院血液科﹐江苏 南京 210008

分子动力学模拟 GROMACS 力场

2016

医学信息
国家卫生部信息化管理领导小组 中国电子学会中国医药信息学分会 陕西文博生物信息工程研究所

医学信息

影响因子:0.161
ISSN:1006-1959
年,卷(期):2016.29(7)
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