空军军医大学学报2023,Vol.44Issue(9) :876-880.DOI:10.13276/j.issn.2097-1656.2023.09.016

基于GEO数据库建立上皮性卵巢癌分子预后风险评分模型

Construction of a molecular prognostic risk score model of epithelial ovarian cancer based on GEO datebase

王兴国 马刚 董健 徐智阳 刘淑娟
空军军医大学学报2023,Vol.44Issue(9) :876-880.DOI:10.13276/j.issn.2097-1656.2023.09.016

基于GEO数据库建立上皮性卵巢癌分子预后风险评分模型

Construction of a molecular prognostic risk score model of epithelial ovarian cancer based on GEO datebase

王兴国 1马刚 2董健 3徐智阳 3刘淑娟3
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作者信息

  • 1. 空军军医大学西京医院妇产科,陕西 西安710032;解放军第93011部队医院,吉林 延边133000
  • 2. 空军军医大学西京医院消化内科,陕西 西安710032
  • 3. 空军军医大学西京医院妇产科,陕西 西安710032
  • 折叠

摘要

目的 探索上皮性卵巢癌预后特征基因并构建分子预后风险评分模型.方法 从GEO数据库中下载GSE26712数据集,其中包括185例上皮性卵巢癌患者和10例正常对照组织的表达数据和相应的临床数据.将上皮性卵巢癌患者分为训练组(129例)和验证组(56例).在GSE26712数据集中筛选差异表达基因并从训练组中识别预后相关基因.对共有的基因进行LASSO和逐步回归,筛选出最佳预后基因,通过多因素Cox比例风险回归确定预后特征基因的回归系数,并构建风险评分模型.受试者工作特征曲线(ROC)、Kaplan-Meier(KM)生存分析和十折交叉验证用于评估其预测能力.结果 筛选出IGFBP4、IGF2、TLR2、DIAPH2、AADAC共5个与卵巢癌预后显著相关的基因.根据5个基因的Cox系数构建风险评分模型进行预后预测分析,KM生存曲线显示高风险组的患者预后更差(P<0.0001).ROC曲线显示1、3、5年的曲线下面积分别为0.813、0.876、0.895.结论 本研究构建的风险评分模型可以较好地预测上皮性卵巢癌患者的预后,为临床医生提供可靠的预后评估工具并辅助临床治疗决策.

关键词

GEO数据库/卵巢癌/基因特征/预后预测

Key words

GEO database/ovarian cancer/genetic characteristics/prognostic prediction

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基金项目

陕西省重点研发计划(2020ZDLSF02-02)

出版年

2023
空军军医大学学报
第四军医大学

空军军医大学学报

CHSSCD
影响因子:0.372
ISSN:2097-1656
被引量1
参考文献量4
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