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基于DNA甲基化驱动基因的肺鳞癌预后列线图的建立

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目的 基于DNA甲基化驱动基因开发预测肺鳞癌患者预后的列线图.方法 通过整合癌症基因组图谱(TCGA)肺鳞癌DNA甲基化和基因表达来鉴定甲基化驱动基因,采用Kaplan-Meier生存分析、LASSO回归和多变量Cox回归分析,建立风险评分模型,再对临床参数进行分析,构建列线图,Hosmer-Lemeshow检验绘制校准曲线对肺鳞癌患者生存率进行校准,受试者工作特征曲线(ROC曲线)评估列线图的预测效能.结果 通过MethylMix分析共筛选了45个DNA甲基化驱动基因,基因功能在丝氨酸家族氨基酸代谢过程、细胞和细胞间黏附连接、细胞和细胞间连接方面显著丰富(P<0.01).经Kaplan-Meier生存分析和LASSO回归分析显示,ATP结合家族亚家族C成员5(ABCC5)、封闭蛋白1重组蛋白(CLDN1)、半胱氨酸蛋白酶蛋白A(CSTA)基因与肺鳞癌患者预后相关(P<0.05).多因素Cox回归分析显示,年龄、TNM分期中N分期和风险评分与肺鳞癌患者的生存时间显著相关(HR=1.73,95％CI 1.09～2.75;HR=2.34,95％CI 1.21～4.52;HR=4.44,95％CI 1.61～12.26)(均P<0.05).构建包含这些变量的列线图,ROC曲线评估显示,该列线图预测肺鳞癌患者3年和5年生存率的准确性较高.结论 DNA甲基化驱动基因(ABCC5、CLDN1和CSTA)的改变与肺鳞癌患者的预后显著相关,构建的列线图模型可用于肺鳞癌患者预后的个体化预测.
Establishment of Prognosis Diagram of Lung Squamous Cell Carcinoma Based on DNA Methylation Driven Genes

吴立波、李广华、于家兴、王秋实

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哈尔滨医科大学附属第二医院胸外科,哈尔滨150086

肺鳞癌 DNA甲基化 生存分析 癌症基因组图谱数据库 列线图模型

北京医学奖励基金会项目研究项目黑龙江省自然科学基金

YXJL-2019-0071-0002H2015004

2022

10.3969/j.issn.1006-2084.2022.01.034

医学综述
中国医疗保健国际交流促进会

医学综述

影响因子：1.144
ISSN：1006-2084
年,卷(期)：2022.28(1)
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