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葛根素与乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟

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旨在阐明葛根素与乙酰胆碱酯酶(AChE)的分子作用机制,并为基于葛根素的类似物的AChE抑制剂的研发提供参考.运用AutoDock 4.2进行葛根素与AChE的分子对接,采用YASARA进行分子动力学模拟,利用MMPBSA.py模块计算复合体系的结合自由能,分析氨基酸的能量贡献.结果显示,葛根素与AChE对接体系含有4个氢键,2个π-π键.5 ns后,体系均方根偏差(RMSD)趋于平衡,体系结合自由能为-18.19 kcal/mol.促体系结合的主要作用力是范德华力、静电作用力,非溶剂化能是主要的结合阻力.能量贡献最大的残基依次为Asn533、Lys530、Ala534、Pro529.这些研究为新型抑制剂的研发提供理论参考.
Molecular dynamics simulation of the interactions between puerarin and acetylcholinesterase

赵奇、邓培渊、王会鱼、罗青、田云芳、王国霞、杨玉珍、李春阁、陈刚

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郑州师范学院 生命科学学院, 郑州450044

阿尔茨海默症 乙酰胆碱酯酶 葛根素 分子动力学 结合自由能

郑州师范学院本科教学改革项目郑州师范学院线上线下混合式-流课程建设项目教育部人文社科青年基金

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2022

10.19855/j.1000-0364.2022.061004

原子与分子物理学报
四川大学,四川省物理学会,中国物理学会原子与分子物理专业委员会

原子与分子物理学报

北大核心
影响因子：0.296
ISSN：1000-0364
年,卷(期)：2022.39(6)
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