原子与分子物理学报2024,Vol.41Issue(1) :51-58.DOI:10.19855/j.1000-0364.2024.011008

手性钌(Ⅱ)配合物与DNA作用性质的计算研究

Computational investigation into properties of chiral Ru(Ⅱ)complexes with DNA

吴明 王俊恩 苗体方
原子与分子物理学报2024,Vol.41Issue(1) :51-58.DOI:10.19855/j.1000-0364.2024.011008

手性钌(Ⅱ)配合物与DNA作用性质的计算研究

Computational investigation into properties of chiral Ru(Ⅱ)complexes with DNA

吴明 1王俊恩 2苗体方2
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作者信息

  • 1. 中兴通讯股份有限公司,南京 211100
  • 2. 淮北师范大学化学与材料科学学院淮北 235000
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摘要

理论考察了手性钌(Ⅱ)配合物1和2与DNA作用性质.首先,构建了手性钌(Ⅱ)配合物1、2与DNA对接模型,并对对接模型进行了优化,通过计算得到的手性钌(Ⅱ)配合物1、2与DNA的结合能,解释了手性钌(Ⅱ)配合物1、2与DNA键合力大小次序,即Kb(∧-1)<Kb(△-1)<Kb(∧-2)<Kb(△-2).另外,通过计算得到的电子转移活化能及自然电荷解释了手性钌(Ⅱ)配合物1和2裂解DNA的效率次序,即φ(∧-2)>φ(△-2)>φ(∧-1)>φ(△-1).最后,通过计算得到的对接模型的分子轨道分析了光裂解DNA的原因.

Abstract

The interactions of chiral Ru(Ⅱ)polypyridyl complexes 1 and 2 with DNA were explored theoretical-ly.Firstly,the DNA-docking models of chiral complexes 1 and 2 were constructed and optimized.The se-quence of DNA binding affinity of chiral Ru(Ⅱ)complexes 1 and 2,i.e.Kb(∧-1)<Kb(△-1)<Kb(∧-2)<Kb(△-2),was explained by the calculated DNA-binding energies.Besides,the sequence of DNA-cleavage efficiencies(φ)of these complexes,i.e.,φ(∧-2)>φ(△-2)>φ(∧-1)>φ(△-1),were explained by the calculated electron-transfer activation energies and nature charges.Finally,the cause of DNA photolysis was analyzed by the molecular orbitals of docking structures.

关键词

手性钌配合物/光裂解效率/自然电荷/理论计算

Key words

Chiral ruthenium complex/Photocleavage efficiency/Nature charge/Theoretical calculation

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基金项目

安徽省自然科学基金(1808085MB45)

出版年

2024
原子与分子物理学报
四川大学,四川省物理学会,中国物理学会原子与分子物理专业委员会

原子与分子物理学报

北大核心
影响因子:0.296
ISSN:1000-0364
参考文献量23
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