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基于DNA条形码的多花黄精系统发育和变异位点分析研究

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目的 对来自不同地域的多花黄精野生资源的核糖体内转录间隔区2(internal transcribed spacer2,ITS2)和psbA-trnH基因间隔区序列进行系统发育分析,探索不同地理来源的多花黄精资源的遗传多样性和亲缘关系.方法 用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)的方法扩增获得多花黄精ITS和psbA-trnH的核酸序列,与美国国家技术信息中心(NCBI)相对应的核酸序列比对获得多花黄精ITS2和psbA-trnH核酸序列.用邻接法(Neighbor joining)构建系统发育树,用Kimuratwo-parameter (K2-P)模型分析遗传距离,用Mega和DNAman软件进行多重比对分析.结果 安徽青阳样品的ITS2序列为224 bp,其余24份样品的ITS2序列均为225 bp,福建泰宁的1份样品为620 bp,其余24份多花黄精样品的psbA-trnH序列均为621 bp,2个序列分别存在7个和4个变异位点.采用ITS2序列构建的系统发育树将25份资源分为2个大的类群,湖南和贵州的5份资源种群聚为一类,其他20份资源聚为一类,遗传距离显示来自贵州花溪、剑河的样品和来自福建建阳的遗传距离最大;采用psbA-trnH序列构建的系统发育树则无法将不同地域多花黄精资源区分开.结论 系统发育和变异位点分析为多花黄精资源的进化研究、道地性评价奠定了理论基础,变异位点的分析可用于相关资源的鉴定.
Phylogenetic and mutation point analysis of DNA barcoding sequences in Polygonatum cyrtonema

周先治、饶宝蓉、高晖、陈阳、林永胜

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福建省农业科学院农业生物资源研究所,福建福州 350003

农业农村部福州热带作物科学观测实验站,福建福州350003

福建省南平市农业科学研究所,福建南平354200

多花黄精 ITS2 psbA-trnH 系统发育 PCR 遗传多样性

福建省农业科学院药用植物创新团队项目热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室开放课题工信部中药材生基地建设项目

STTT2017-2-81630052017020-3

2020

10.7501/j.issn.0253-2670.2020.15.020

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2020.51(15)
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