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人参bZIP基因家族生物信息学分析

Bioinformatics analysis of bZIP gene family of Panax ginseng

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目的 通过人参bZIP基因家族生物信息学分析,为人参功能基因开发利用提供理论依据.方法 运用PlantTFDB数据库预测人参基因组中bZIP基因;通过ExPASy网站得到人参bZIP基因家族信息和特征;使用MEME网站对PgbZIP基因家族保守基因序列进行分析;运用MEGA软件建立PgbZIP基因家族系统进化关系;利用TBtools软件进行PgbZIP表达分析.结果 人参基因组中含有157个bZIP基因家族成员,其中152个定位在细胞核,其余5个分别定位在叶绿体和内质网,相对分子质量在14009.93～83 440.38,等电点在4.53～10.05,氨基酸数目在120～760aa,除PgbZIP157以外,均为亲水蛋白.PgbZIP131在干旱胁迫下的表达量为83.47;PgbZIP99在根和盐胁迫条件下表达量均最高,分别为119.82和117.86;PgbZIP117在叶中表达量为48.54;花中PgbZIP106表达量最高为79.55;成熟果实中表达量最高是PgbZIP118,为119.32;PgbZIP101在未成熟果实中的表达量最高,且为65.32.结论 推测PgbZIP99与同源基因AtbZIP11功能相似,可以调控根的分生组织活性;PgbZ1P131在干旱胁迫条件下表达量最高,推测PgbZIP131对干旱胁迫有重要调控作用;A亚族成员ABF2/AREB1(AtbZIP36)、ABF3(AtbZIP37)、ABF4/AREB2(AtbZIP38)参与干旱胁迫和盐胁迫调控,推测与A亚族成员具有同源关系的PgbZIP74、PgbZIP132,PgbZIP122、PgbZIP112在干旱胁迫和盐胁迫条件下具有相似调控作用.

王思嘉、孙嘉莹、刘美琦、任伟超、于欣欣、刘秀波、马伟

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黑龙江中医药大学药学院,黑龙江哈尔滨 150040

黑龙江中医药大学佳木斯学院,黑龙江佳木斯 154007

教育部北药基础与应用研究重点实验室,黑龙江哈尔滨 150040

人参 bZIP 生物信息学 基因家族 盐胁迫 干旱胁迫

黑龙江省头雁团队项目黑龙江中医药大学科研基金中药健康相关产品研发及产业化专项

黑龙江省头雁行动领导小组文件[2019]5号2019BJP06

2022

10.7501/j.issn.0253-2670.2022.09.022

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2022.53(9)
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