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金线莲中调控胚胎发育WRKY转录因子筛选及克隆分析

Screening and cloning analysis of WRKY transcription factor regulating embryo development from Anoectochilus roxburghii

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目的 探究金线莲Anoectochilus roxburghii中WRKY转录因子时空表达模式并筛选调控金线莲胚胎发育的ArWRKY基因.方法 基于金线莲转录组数据库进行ArWRKY转录因子筛选,利用软件进行蛋白质结构域预测、序列比对、理化性质预测与进化树构建等分析.采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测ArWRKY基因时空表达模式.根据转录组数据Unigenes克隆ArWRKY的CDS序列.结果 筛选得到金线莲中23条WRKY转录因子,分别命名为ArWRKY1～ArWRKY23;qRT-PCR结果表明ArWRKY5与ArWRKY20基因在金线莲叶芽期、花芽期及开花期的花中表达量都显著高于根、茎、叶;克隆得到ArWRKY5的CDS为600 bp,ArWRKY20的CDS为1149 bp.结论 筛选得到23个ArWRKY转录因子并成功克隆获得ArWRKY5与ArWRKY20的CDS序列,对探究ArWRKY转录因子调控金线莲生长发育及验证ArWRKY5与ArWRKY20基因功能奠定基础.

邢丙聪、苏立样、万思琦、邵清松

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浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室,浙江杭州 311300

浙江农林大学中药学科,浙江杭州 311300

金线莲 胚胎发育 WRKY转录因子 生物信息学分析 表达模式

国家自然科学基金浙江省农业新品种选育重大科技专项浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室项目

821739162021C020742021E10013

2022

10.7501/j.issn.0253-2670.2022.12.021

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2022.53(12)
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