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杜仲TCP转录因子鉴定及生物信息学分析

Identification and bioinformatics analysis of TCP transcription factors in Eucommia ulmoides

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目的 对杜仲TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族进行筛选分析,以期为EuTCPs基因功能深入研究奠定基础.方法 以杜仲基因组数据库为基础,通过生物信息学系统分析TCP基因家族的理化性质、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及其在杜仲叶片发育及胶形成中的表达水平.结果 从杜仲基因组中共鉴定到14个EuTCPs,氨基酸数目介于139～492,理论等电点分布在5.54～9.72,相对分子质量区域为18 880～53 620,亚细胞定位预测在细胞核中,均为亲水性蛋白.系统进化分为PCF、CIN和CYC/TB1 3个亚家族,分别包含5、6和3个EuTCPs蛋白.表达模式分析显示,EuTCPs在杜仲叶片不同发育时期存在显著差异,每个发育时期EuTCPs表达量各不相同,EuTCPs正调控杜仲胶的形成.结论 杜仲中TCP家族包含14个成员,各成员的分子特征和组织表达特异性存在一定的差异,EuTCPs可能参与杜仲叶片发育及杜仲胶的形成.

刘俊、李龙、吴耀松、刘燕、任闪闪、陈玉龙

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河南中医药大学中医药科学院河南省中医方证信号传导重点实验室,河南郑州 450046

国际竹藤中心国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京100102

国际竹藤中心安徽太平试验中心,安徽黄山245716

西北农林科技大学林学院,陕西杨凌 712100

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杜仲 TCP转录因子 系统进化 表达分析 叶片发育

河南省高等学校重点科研项目国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室开放基金国际竹藤中心安徽太平试验中心开放课题河南中医药大学博士科研基金

22A360005ICBR-2020-051632021006-4RSBSJJ2019-04

2022

10.7501/j.issn.0253-2670.2022.12.022

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2022.53(12)
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