基于SSR荧光标记的不同品种(系)当归遗传关系分析及分子身份证构建

Genetic relationship analysis and molecular ID codes construction of different cultivars(lines)of Angelica sinensis based on fluorescent labeled SSR markers

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中文摘要：目的利用荧光SSR分子标记对甘肃省11个当归Angelica sinensis品种(系)194份当归样品进行遗传多样性和遗传结构分析,并构建其分子身份证,为当归新品种(系)选育提供科学依据.方法采用课题组前期筛选出10对SSR荧光引物对供试材料进行PCR扩增,利用Popgen软件进行遗传参数的计算,利用Structure软件进行群体结构分析,利用NTSYS软件构建各居群的Nei's遗传距离UPGMA聚类图,利用GenALEx软件进行分子方差分析;对扩增带型进行数字加字母编码,构建当归分子身份证.结果 10对SSR荧光引物共获得观测等位位点57个,平均每对引物5.7个,当归群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和Nei期望杂合度(Nei)分别为0.341 4、0.407 0和0.385 5;Structure分析将194份当归样品分成5个类群;当归品种(系)居群间的分化系数FST为0.147 7;分子方差分析显示居群内的变异百分比达到78％;最终利用10对SSR荧光引物,构建了 10位字符的分子身份证,可以区分11个当归品种(系).结论栽培当归在物种水平上遗传多样性较高,各品种(系)间遗传分化系数较低,基因交流频繁,遗传变异主要存在于居群内;构建的分子身份证可以区分不同当归品种(系).

作者：

朱田田、张明惠、王富胜、王圆圆、栗孟飞、晋玲

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作者单位：

甘肃中医药大学,甘肃兰州 730000

西北中藏药省部共建协同创新中心,甘肃兰州 730000

甘肃省高校中(藏)药化学与质量研究省级重点实验,甘肃兰州 730000

定西市农业科学研究院,甘肃定西 743000

甘肃农业大学干旱生境作物学重点实验室,甘肃兰州 730070

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关键词：

当归 SSR荧光标记亲缘关系分子身份证遗传多样性

基金：

甘肃省科技厅创新基地和人才计划国家自然科学基金国家自然科学基金甘肃省教育厅"双一流"科研重点项目甘肃省高校中(藏)药化学与质量研究省级重点实验室开放基金甘肃中医药大学科学研究与创新基金

项目编号：

20JR5RA1823216008381360615GSSYLXM-05zzy-2019-042021KCZD-4

出版年：

2022

DOI：

10.7501/j.issn.0253-2670.2022.12.024

中草药

天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：1.632

ISSN：0253-2670

年,卷(期)：2022.53(12)

被引量8
参考文献量13