首页|尖刀唇石斛和翅梗石斛叶绿体全基因组分析

尖刀唇石斛和翅梗石斛叶绿体全基因组分析

扫码查看
原文链接
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
目的 测定尖刀唇石斛Dendrobium heterocarpum和翅梗石斛D.trigonopus叶绿体基因组,分析其序列特征并鉴定石斛属Dendrobium植物物种间亲缘关系.方法 利用Illumina Hisep 2 500测序平台对尖刀唇石斛和翅梗石斛进行二代测序,经组装、注释后得到2条完整的叶绿体全基因组序列,采用生物信息学方法分析其序列结构及石斛属的系统发育关系.结果 尖刀唇石斛的叶绿体全基因组总长为159 786 bp,总GC含量为37.2％,共注释得到131个基因,包括88个蛋白编码基因、37个tRNA基因和6个rRNA基因;翅梗石斛的叶绿体全基因组总长为159 652 bp,总GC含量为37.1％,共注释得到131个基因,包括88个蛋白编码基因、37个tRNA基因和6个rRNA基因.尖刀唇石斛和翅梗石斛分别检测到112和127个简单重复序列(SSR),二者编码亮氨酸的密码子数量最多,编码色氨酸的密码子数量最少.系统发育树显示,尖刀唇石斛、反瓣石斛D.ellipsophyllum、翅梗石斛、梳唇石斛D.strongylanthum和长距石斛D.longicornu聚为一支,翅梗石斛与梳唇石斛和长距石斛的亲缘关系十分相近,支持率达到100％.结论 对石斛属2种植物的叶绿体基因组结构和系统发育关系进行了分析,该研究结果将为石斛属药用植物的准确鉴定、开发利用及其资源保护提供科学依据.
Sequence analysis of complete chloroplast genome of Dendrobium heterocarpum and Dendrobium trigonopus

李卓蔚、邱迁、郎佳琪、吴应梅、杜慧慧、周浓

展开 >

重庆三峡学院生物与食品工程学院,重庆 404120

三峡库区道地药材绿色种植与深加工重庆市工程实验室,重庆 404120

尖刀唇石斛 翅梗石斛 药用植物 叶绿体全基因组 亲缘关系

cstc2018jcyjAX0267

2022

10.7501/j.issn.0253-2670.2022.16.025

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2022.53(16)
  • 6
  • 20