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当归MADS-box生物信息学及SOC1克隆与表达分析

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目的 对当归Angelica sinensis MADS-box基因家族进行筛选与生物信息学分析,并对SOC1-4基因进行克隆与表达验证.方法 基于当归全长转录组筛选MADS-box基因家族,利用在线工具进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR检测SOC1-4基因在不同材料中的表达水平.结果 当归全长转录组中含有29个MADS-box基因家族成员,可分为10个亚家族,共含有6个保守基序,蛋白质序列长度为49～422 aa,相对分子质量为5 697.56～49 624.90,等电点为5.06～11.00,亚细胞结果显示当归MADS-box基因家族成员分别定位于叶绿体、细胞核、细胞质和线粒体,二级结构预测及3D建模显示同一亚家族结构相似;SOC1-4基因克隆片段与全长转录组测序结果一致;SOC1-4基因随种苗春化作用和植株发育时期延长呈现高表达,在抽薹植株、茎和叶中高表达,而在冷冻规避春化作用种苗中呈现低表达.结论 当归含有29个MADS-box成员,各成员理化性质和结构存在一定的差异,SOC1-4基因表达水平与当归抽薹开花生理调控一致,为当归MADS-box基因家族调控抽薹开花相关研究提供借鉴.
Analysis on MADS-box bioinformatics,SOC1 clone and expression pattern in Angelica sinensis

崔秀文、刘迪、黄天苗、李美玲、栗孟飞、魏建和

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甘肃农业大学生命科学技术学院干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃兰州 730070

中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193

当归 MADS-box 生物信息学 SOC1-4 基因克隆 抽薹开花

国家自然科学基金干旱生境作物学国家重点实验室(甘肃农业大学)基金道地药材生态种植与质量保障项目现代农业产业技术体系建设项目

32160083GSCS-2021-Z03202103003CARS-21

2023

10.7501/j.issn.0253-2670.2023.05.022

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2023.54(5)
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