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基于SSR分子标记的裸花紫珠种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

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目的 研究裸花紫珠Callicarpa nudiflora种质资源遗传多样性,为其种质资源鉴定及优异种质筛选提供依据.方法 采用SSR分子标记技术,探究103份裸花紫珠种质遗传多样性,基于遗传距离进行UPGMA聚类分析,以SSR扩增条带为基础建立供试材料扩增条带DNA指纹图谱.结果 14对引物共扩增出92个等位基因(number of alleles,Na),有效等位基因(effective number of alleles,Ne)占比 39.37％.平均多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.468 2,6对引物具有高度多态性(PIC＞0.5),6对具有中度多态性(0.25＜PIC＜0.5).平均Nei多样性指数(Nei's gene diversity index,H)和 Shannon 指数(Shannon's information index,I)分别为 1.039 0、0.505 1,表现出较高的遗传多样性水平.聚类分析将材料分为2大类:类群Ⅰ包括2份种质;类群Ⅱ包含101份种质,并分为2个亚类.主坐标分析将材料分为3个类群,与聚类结果基本一致.构建的指纹图谱通过引物组合能较好地将种质进行区分.结论 103份裸花紫珠种质具有丰富的遗传多样性,并成功利用14对SSR引物构建裸花紫珠种质DNA指纹图谱,可为裸花紫珠种质鉴定、亲缘关系以及分子辅助育种提供科学依据.
Genetic diversity analysis and DNA fingerprints construction of Callicarpa nudiflora germplasm resources based on SSR markers

Callicarpa nudiflora Hook.et Arn.SSR molecular markergenetic diversitygenetic distancecluster analysisprincipal coordinate analysisDNA fingerprinting

张红瑞、李鑫、陈振夏、胡文斌、李伟、黄梅、于福来、杨林立

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河南农业大学农学院,河南郑州 450046

中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业农村部中药材生物学与栽培重点实验室/海南省热带药用植物工程研究中心,海南海口 571101

海南九芝堂药业有限公司,海南海口 570311

河南省中医院,河南郑州 450053

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裸花紫珠 SSR分子标记 遗传多样性 遗传距离 聚类分析 主坐标分析 DNA指纹图谱

海南省重大科技计划海南省自然科学基金

ZDKJ2021001322QN393

2023

10.7501/j.issn.0253-2670.2023.12.023

中草药
天津药物研究院,中国药学会

中草药

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.632
ISSN：0253-2670
年,卷(期)：2023.54(12)
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