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苜蓿属不同物种叶绿体基因组结构比较及亲缘关系分析

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以苜蓿属24个种1个亚种叶绿体基因组为研究对象,利用REPuter、mVISTA和MAFFT等分析叶绿体基因组的重复序列、序列变异情况及进化关系.结果 表明,苜蓿属不同种间叶绿体基因组介于121313～132269bp之间,编码110～118个基因,基因数目的 差异主要是因蛋白编码基因数目不一所致.在苜蓿叶绿体基因组中共检测出49～59个重复序列,鉴定出139～163个SSR位点且单碱基重复居多数.序列多样性比对表明,非编码序列在各物种间的差异性较大.此外,筛选到2个核苷酸多样性较高的基因,即clpP和ycf1.通过Maximum likelihood (ML)构建的系统发育树表明,Medicago edgeworthii(毛荚苜蓿)、Medicago archiducis-nicolai(青海苜蓿)和Medicago ruthenica(扁蓿豆)亲缘关系较近.
Comparison of Chloroplast Genome Structure and Phylogenetic Analysis of Different Species of Medicago

田春育、李志勇、刘倩、于林清、武自念

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中国农业科学院草原研究所,内蒙古呼和浩特010010

内蒙古大学生态与环境学院,内蒙古呼和浩特010021

苜蓿属卅绿体全基因组 结构变异 系统发育

科技基础资源调查专项——草原区生物多样性综合考察(2019FY102003)内蒙古自治区科技计划内蒙古自治区科技计划内蒙古自治区自然科学基金

2020GG00632019GG2602018M S03001

2021

10.16742/j.zgcdxb.20210115

中国草地学报
中国农业科学院草原研究所 中国草地学会

中国草地学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.347
ISSN：1673-5021
年,卷(期)：2021.43(10)
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