中国草地学报2023,Vol.45Issue(5) :1-8.DOI:10.16742/j.zgcdxb.20220312

基于SCoT分子标记的苇状羊茅品种遗传关系及指纹图谱分析

Analysis of Genetic Relationships and Fingerprints of Festuca arundinacea Based on SCoT Molecular Markers

赵旭 陈仕勇 余静菠 张慧丽 关皓 周青平
中国草地学报2023,Vol.45Issue(5) :1-8.DOI:10.16742/j.zgcdxb.20220312

基于SCoT分子标记的苇状羊茅品种遗传关系及指纹图谱分析

Analysis of Genetic Relationships and Fingerprints of Festuca arundinacea Based on SCoT Molecular Markers

赵旭 1陈仕勇 2余静菠 1张慧丽 1关皓 1周青平1
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作者信息

  • 1. 西南民族大学青藏高原研究院,四川 成都 610041
  • 2. 西南民族大学畜牧兽医学院,四川 成都 610041
  • 折叠

摘要

采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)对13个苇状羊茅品种进行遗传多样性、遗传结构及指纹图谱分析,以期为苇状羊茅种质资源鉴定、野生种质资源驯化及新品种培育提供理论依据.从80个SCoT引物中筛选出多态性较好、条带清晰且重复性高的引物15个进行扩增,13个苇状羊茅品种共扩增出181条条带,平均每个引物扩增12.07条.其中,多态性条带共176条,不同引物扩增的多态性条带数在7~16条之间,平均每个引物扩增多态性条带为11.73条,多态性条带比率(PPB)为97.24%;有效等位基因数范围在1.311~1.642之间,平均为1.511;基因多样性指数范围在0.184~0.357之间,平均为0.294;Shannon指数范围在0.276~0.518之间,平均为0.435.供试的13个品种间的遗传距离在0.0444~0.1401之间,平均值为0.1003;基于遗传距离的UPGMA聚类分析可将13个品种分为两类,与遗传结构分析结果一致.分子方差分析结果表明,总的遗传变异中有14%发生在品种间,有86%发生在品种内.引物SCoT10、SCoT56、SCoT80可以完全区分供试苇状羊茅品种,采用SCoT10引物扩增出的7个多态性位点成功构建了 13个苇状羊茅品种的指纹图谱.

关键词

苇状羊茅/SCoT/指纹图谱/亲缘关系

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基金项目

四川省"十四五"饲草育种攻关项目(2021YFYZ0013)

国家牧草产业技术体系建设项目(CARS34)

西南民族大学研究生创新型科研项目(ZD2022144)

出版年

2023
中国草地学报
中国农业科学院草原研究所 中国草地学会

中国草地学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.347
ISSN:1673-5021
参考文献量14
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