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基于GEO基因芯片结合网络药理学和分子对接技术探究玉屏风散治疗原发性肾病综合征的作用机制研究

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目的 利用GEO基因芯片结合网络药理学和分子对接技术探究玉屏风散(YPFP)治疗原发性肾病综合征(primary nephrotic syndrome,PNS)的作用机制.方法 利用TCMSP数据库、文献挖掘以及靶点预测工具Swiss Target Prediction数据库筛选YPFS活性成分及其对应的作用靶点,通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库检索PNS靶点,再结合GEO基因芯片,汇总得到PNS疾病靶点,将所得活性成分作用靶点与疾病靶点取交集,借助可视化软件Cytoscape 3.9.1 软件构建"YPFP-药物成分-交集靶点"网络,应用STRING数据库进行蛋白互作分析,获取核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行GO基因功能以及KEGG信号通路富集分析.应用AutoDock Tools-1.5.6 软件进行分子对接分析.结果 得到YPFP活性成分 56 个,与PNS的交集靶点 136 个,拓扑分析提示YPFP治疗PNS的核心成分为槲皮素、山奈酚、汉黄芩素、升麻素、β-谷甾醇等.获取核心靶点 40 个,TP53、SRC、JUN、RELA、AKT1 等可能是关键靶点.GO富集分析得到 1 192 个生物过程,66 个分子功能,44 个细胞组分.KEGG通路富集分析得到糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、HIF-1 信号通路、TGF-β信号通路、Wnt信号通路等 165 条相关信号通路.分子对接结果显示YPFP的核心成分与关键靶点具有较好的结合活性.结论 YPFP治疗PNS具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,本研究为今后治疗PNS的深入研究提供科学依据.
Mechanism of Yupingfeng Powder in the treatment of primary nephrotic syndrome based on GEO gene chip,network pharmacology and molecular docking technology

Yupingfeng PowderPrimary nephrotic syndromeGEO gene chipNetwork pharmacologyMolecular docking

徐奥、周慧玲、沈铁柱、李景、曾钰钰、金牮

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江苏海洋大学药学院,江苏连云港 2220005

玉屏风散 原发性肾病综合征 GEO基因芯片 网络药理学 分子对接

2023

中国处方药
南方医药经济研究所

中国处方药

影响因子：0.649
ISSN：1671-945X
年,卷(期)：2023.21(10)
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