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杜泊羊LEF1生物信息学及表达分析

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旨在对杜泊羊LEF1基因进行生物信息学分析和编码蛋白功能特征预测,探究其对毛囊发育的调控机制,及其在毛囊不同发育时期中的表达量.从试验羊场选择2周岁体重相近的5只杜泊母羊,利用生物信息学方法比对绵羊LEF1氨基酸序列与其他物种的亲缘性,分析LEF1蛋白质的理化性质和结构特征;利用实时荧光定量PCR检测其在杜泊羊体测腹部皮肤的表达量.结果表明,杜泊羊LEF1蛋白的氨基酸序列与牛的亲缘关系最近,与小鼠的亲缘关系最远.LEF1基因编码的氨基酸331个;LEF1基因编码的蛋白质分子式C1636H2534N478O481S15,相对分子质量37075.95 ku,理论等电点数值9.52,亲水性平均值-0.906;编码蛋白的二、三级结构主要由无规卷曲(57.7%)和α-螺旋(28.1%)组成,同时包含1个糖基化位点.LEF1基因在杜泊羊毛囊不同发育时期均有表达,在9月和3月高表达,在1月低表达.综上,LEF1基因在杜泊羊毛囊的生长期高表达.
LEF1 Bioinformatics and Expression Analysis in Dorper Sheep

王翊帆、王雅艳、李新海

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宁夏大学农学院,银川 790021

杜泊羊 LEF1 生物信息学

国家自然科学基金

31960650

2022

中国草食动物科学
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

中国草食动物科学

影响因子:0.61
ISSN:2095-3887
年,卷(期):2022.42(4)
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