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羊传染性脓疱病毒NZ2毒株CBP蛋白结构分析与表位预测

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本研究应用生物信息学方法,以ORFV NZ2毒株的CBP蛋白氨基酸序列为研究对象,对CBP蛋白的理化特性、亲水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构、B细胞表位和T细胞表位进行了预测分析.结果显示,CBP蛋白的相对分子质量为31.17989 kDa,理论等电点为4.68,半衰期为30 h,稳定系数为43.06,脂肪族指数为81.78,总平均亲水性为-0.383.CBP蛋白为亲水性蛋白,无跨膜区,不属于跨膜蛋白,存在信号肽;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占38.11％、33.91％、5.94％和10.48％,三级结构形似倒立的哑铃,上下对称.筛选出了6个优势B细胞表位、3个CTL细胞表位,无Th细胞表位.CBP蛋白为亲水性膜外蛋白,细胞表位较少,在细胞膜外为ORFV逃避宿主免疫反应发挥作用.本研究为CBP蛋白的功能研究与ORFV的致病机制研究提供了理论依据.
Structural Analysis and Epitope Prediction of CBP of ORFV NZ2 Strain

成伟伟、陈伯祥、常攀峰、杨明、赵子惠

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甘肃省畜牧兽医研究所,甘肃平凉 744000

羊传染性脓疱病毒 CBP蛋白 生物信息学 结构分析 表位预测

甘肃省重点研发计划项目

18YF1NA021

2019

中国动物检疫
中国动物卫生与流行病学中心

中国动物检疫

影响因子：0.437
ISSN：1005-944X
年,卷(期)：2019.36(12)
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