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北京地区食源性单增李斯特菌基因分型分析

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目的 对北京地区肉类产品中单增李斯特菌进行全基因组测序,了解不同序列型分布特点及不同菌株间的亲缘关系。方法 采用高通量测序技术对110株单增李斯特菌进行全基因组测序、多位点序列分型(MLST)分析,采用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释。采用抗性基因数据库(CARD)、毒力因子数据库(VFDB)筛选耐药基因、致病基因。结果 110株分离菌株全基因组测序MLST分型共分为17个ST型,其中1株菌为ST新型(STnew1),ST9为优势型。新型STnew1具有大环内酯类、氨基糖苷类、恶唑烷酮类、氯霉素类、四环素类、甲氧苄氨嘧啶类等多种耐药基因,缺失基因prfA、hpt、plcA、plcB、inlC、hlyA。其中20。9%的菌株均携带耐药基因。除6株无害李斯特菌外,其余菌株均携带单增李斯特菌毒力岛(LIPI-1)。结论 肉类食品中单增李斯特菌存在多种耐药基因,毒力基因分布以毒力岛(LIPI-1)为主,具有潜在的致病性;相关部门应加强肉类及肉类制品的监管,进一步降低单增李斯特菌所致食源性疾病流行风险。
Genotyping analysis on foodborn Listeria monocytogenes starins isolated in Beijing region

畅晓晖、万晓楠、张捷、石嵩、柳明、杨向莹、王华、李小林、赵琢

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中国海关科学技术研究中心,北京100026

天津海关工业产品安全技术中心

全基因组测序 单增李斯特菌 基因分型 毒力基因 耐药基因

国家重点研发计划"食品安全关键技术研究"重点专项

2018YFC1603800

2022

中国公共卫生
中华预防医学会

中国公共卫生

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.404
ISSN:1001-0580
年,卷(期):2022.38(1)
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