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胃癌预后全基因组关联分析

Gastric cancer prognosis-related single nucleotide polymorphisms:a genome-wide association analysis

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目的 探讨胃癌预后相关的全基因组单核苷酸多态性(SNPs)位点,为识别胃癌预后生物标志物、开发个性化胃癌治疗策略提供新的思路.方法 对2013年4月-2017年12月在福建省仙游县医院新确诊的251例胃癌患者进行随访研究,采用Kaplan-Meier法计算5年生存率,通过全基因组芯片检测胃癌患者的全基因组SNPs位点,并应用Cox比例风险回归模型探索胃癌预后相关的SNPs位点.结果 有效随访胃癌患者218例,随访率为86.85％,1、3、5年生存率分别为61.5％、40.8％、37.5％,中位生存期为22.0个月;单因素Cox比例风险回归模型分析结果显示,年龄≥65岁、TNM分期中期和晚期是胃癌预后不良的危险因素,接受手术治疗和化疗治疗为胃癌预后不良的保护因素;胃癌预后的全基因组关联分析(GWAS)发现165个与胃癌预后存在全基因组显著性关联的遗传位点,涉及33个功能区域,对应55个功能基因,主要参与生长因子反应通路、免疫逃逸、炎性相关通路等生物过程,其中7个基因的表达在TCGA数据库中显示与胃癌预后显著相关.结论 SNPs与胃癌预后紧密相关,胃癌预后功能基因广泛参与癌细胞增殖、免疫、炎症等生物过程.

任南、吕雪洁、何陈周、康淑玲、李沛欣、颜伟、刘宝英、吕燕萍、吴传城

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福建医科大学公共卫生学院,福建福州350122

福州市疾病预防控制中心公共卫生科

福建省莆田市仙游县总医院

福建医科大学附属第二医院医务部

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胃癌 预后 全基因组关联分析

福建省自然科学基金福建省自然科学基金福建省仙游县消化道肿瘤病因学、流行病学研究项目

2015J016732017J018112013B008

2023

10.11847/zgggws1138728

中国公共卫生
中华预防医学会

中国公共卫生

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.404
ISSN：1001-0580
年,卷(期)：2023.39(2)
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