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鸭源新城疫病毒SS1株全基因序列测定及遗传进化分析

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对从贵州省某三穗鸭养殖场病死鸭体内分离的1株新城疫病毒(NDV)Sheldrake duck/China/Guizhou/SS1/2014(简称SS1株)进行部分生物学特性测定及全基因测序与分析.结果表明:SS1株的MDT、ICPI和IVPI分别为52 h、1.89和2.80,F基因编码蛋白的裂解位点序列为112R-R-Q-K-R-F117,HN基因编码571个氨基酸,均符合NDV强毒株特征;SS1株基因组全长为15 192 bp,各基因片段核苷酸序列与代表性基因Ⅶ型毒株ZJ1、NA-1、SF02和FP1/02相似性最高,达96.3％～98.7％,而与疫苗株V4、La Sota和Mukteswar同源性最低,为82.8％～85.4％;根据F基因序列绘制的系统进化树显示SS1株属于ClassⅡ基因Ⅶd亚型.F和HN蛋白氨基酸序列分析发现,SS1株F蛋白中和抗原位点第170位氨基酸、HN蛋白抗原区及其邻近氨基酸位点与国内当前流行的基因Ⅶd亚型NDV毒株一致,而与疫苗株有较大的差异.此外,交叉血凝抑制试验结果表明,SS1株与传统疫苗株La Sota的抗原同源性为84.5％,而与新型基因Ⅶ型疫苗株A-Ⅶ的抗原同源性为100％,表明分离株与疫苗株存在一定的抗原差异.

罗宇宏、陈强、阮涌、主性、段志强、胡顺林、刘秀梵

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贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室,贵州贵阳550025

扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室,江苏扬州 225009

三穗鸭 新城疫病毒 全基因测序 遗传进化

教育部“促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目”公益性行业(农业)科研专项贵州省省校合作计划项目贵州大学引进人才科研项目

教外司美[2014]2029号201303033黔科合LH字[2014]7669号贵大人基合字[2014]10号

2016

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中国家禽
中国畜牧业协会 中国农科院家禽研究所 江苏省家禽科学研究所

中国家禽

北大核心
影响因子：0.482
ISSN：1004-6364
年,卷(期)：2016.38(12)
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