中国家禽2017,Vol.39Issue(20) :11-17.DOI:10.16372/j.issn.1004-6364.2017.20.003

坝上长尾鸡线粒体DNA D-loop序列变异与起源分化研究

Study on Sequence Variation and Origin Based on mtDNA D-loop of Bashang Long-tail Chicken

王涵 陈烨 岳巧娴 赵彩娟 周荣艳 李兰会 张振红 李祥龙
中国家禽2017,Vol.39Issue(20) :11-17.DOI:10.16372/j.issn.1004-6364.2017.20.003

坝上长尾鸡线粒体DNA D-loop序列变异与起源分化研究

Study on Sequence Variation and Origin Based on mtDNA D-loop of Bashang Long-tail Chicken

王涵 1陈烨 1岳巧娴 1赵彩娟 1周荣艳 1李兰会 1张振红 1李祥龙2
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作者信息

  • 1. 河北农业大学,河北保定071000
  • 2. 河北科技师范学院,河北秦皇岛066004
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摘要

为了更好地保护和利用坝上长尾鸡的品种资源,且从母系遗传的角度探明坝上长尾鸡的遗传多样性与起源分化,试验采用PCR直接测序法,测定了30只坝上长尾鸡线粒体DNA(mtDNA)D-loop区1 491bp片段序列.结果显示:在所测定的mtDNA D-loop序列中,A、G、T和C碱基的平均含量分别为28.02%、13.91%、30.97%、27.10%.共检测到1个插入/缺失和32个变异位点,组成17个单倍型.单倍型多样度为0.945±0.025,群体内序列间核苷酸平均差异数为8.536,核苷酸多样度为0.00573,平均遗传距离为0.006.由最大似然法构建的NJ系统进化树将坝上长尾鸡聚为3大支,划分为与A、B、C3个类群.与其它家鸡品种类比,显示其独特性.与原鸡亚种类比,发现A类群起源于原鸡海南亚种,B类群起源于原鸡印度亚种,C类群起源于原鸡滇南亚种.结果表明:坝上长尾鸡遗传多样性丰富,并具有独特性;坝上长尾鸡存在3个区分明显的母系来源.

关键词

坝上长尾鸡/线粒体DNA/D-loop/单倍型/遗传多样性/起源分化

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基金项目

河北省首批青年拔尖人才支持计划(2016-2018)

河北农业大学青年学术带头人支持项目(2015-2017)

河北省现代农业产业技术体系()

出版年

2017
中国家禽
中国畜牧业协会 中国农科院家禽研究所 江苏省家禽科学研究所

中国家禽

北大核心
影响因子:0.482
ISSN:1004-6364
被引量2
参考文献量15
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