分泌性磷酸蛋白SPP1在多种肿瘤的免疫浸润相关性分析
Immunoinfiltration correlation analysis of secreted phosphoprotein SPP1 in multiple tumors
陈洁 1陈琳 2谷延伦 2张默 3门展宇 4汪露 2庞晓丛5
作者信息
- 1. 徐州医科大学药学院,江苏徐州 221009;北京大学第一医院临床药理研究所,北京 100034
- 2. 北京大学第一医院临床药理研究所,北京 100034;北京大学第一医院药学部,北京 100034
- 3. 北京大学第一医院中西医结合科,北京 100034
- 4. 海南科技职业大学化学与材料工程学院,海南海口 571137
- 5. 徐州医科大学药学院,江苏徐州 221009;北京大学第一医院临床药理研究所,北京 100034;北京大学第一医院药学部,北京 100034;北京大学第一医院中西医结合科,北京 100034
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摘要
目的 利用生物信息学方法研究分泌性磷酸蛋白1(SPP1)在多种癌症中与免疫浸润的相关性,探究基因在癌症中与免疫细胞的作用机制.方法 癌症样本来自TCGA、GTEx数据库,使用基因表达谱相互作用分析(GEPIA2)比较SPP1在肿瘤和正常组织中的表达差异,利用TIMER2数据库分析SPP1 mRNA与细胞外基质中不同免疫细胞之间的相关性,在STRING网站探究与SPP1作用关联紧密的分子,利用CancerSEA数据库分析SPP1在不同肿瘤中的显著性功能状态.结果 在32种肿瘤类型中,SPP1 mRNA在23种癌症中表达显著增高,基因的高表达与成纤维细胞(CAF)、整合素家族和CD44分子密切关联.SPP1基因在肿瘤血管侵袭、转移、DNA损伤和修复等肿瘤功能状态方面表现出明显的特异性.结论 SPP1在肿瘤中的表现具有特异性,与细胞外基质中的肿瘤免疫细胞具有紧密的关联,可以促进肿瘤的进展和侵袭,表明SPP1可以作为一种潜在的癌症诊疗生物标志物.
Abstract
Objective To utilize bioinformatic approaches to elucidate the correlation between secreted phosphoprotein 1(SPP1)and immune infiltration in various malignancies,elucidating the mechanism of gene function in cancer-immune cell interplay.Methods Cancer samples were derived from the Cancer Genome Atlas(TCGA)and Genotype-tissue Expression(GTEx)database,examining SPP1 expression difference between tumors and normal tissues using Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA2),and its correlation with different immune cells in extracellular matrix via TIMER2 Database.SPP1's association with interacting molecules was scrutinized on the STRING website,followed by assessment of its distinct functional state across various cancers from Cancer Single-cell State Atlas Database(Cancer SEA).Results In 32 tumor types,SPP1 mRNA is significantly elevated in 23 types of cancers and correlates heavily with fibroblast,integrin family,and CD44.Furthermore,the SPP1 gene exhibits profound specificity in tumor functions such as vascular invasion,metastasis,DNA damage,and repair.Conclusion Specific expression of SPP1 in tumors signifies a significant correlation with tumor immune cells in the extracellular matrix,promoting tumor progression and invasion.This suggests that targeted monitoring of SPP1 could serve as a prospective cancer diagnostics/therapeutics biomarker.
关键词
分泌性磷酸蛋白1/巨噬细胞/免疫浸润/细胞外基质/泛癌分析Key words
secreted phosphoprotein 1/macrophage/immunoinfiltration/extracellular matrix/pan-cancer analysis引用本文复制引用
基金项目
国家重点研发计划基金资助项目(2020YFC2008304)
国家自然科学基金面上资助项目(82274015)
出版年
2024
国家科技期刊平台
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