摘要
目的 研究生物信息学分析糖尿病肾病铁死亡的潜在关键基因及通路.方法 利用高通量基因表达(GEO)数据库下载5个糖尿病肾病(DN)肾间质组织数据集,获取DN肾间质铁死亡基因,鉴定参与DN肾间质铁死亡的重要通路及关键基因.Nephroseq分析关键基因临床意义及诊断价值.实时定量聚合酶链反应(RQ-PCR)验证关键基因表达.结果 共筛选出119个DN肾间质铁死亡基因,主要被富集在代谢、脂质过氧化等信号通路.筛选出7个DN铁死亡关键基因(TFRC、PTEN、NFE2L2、ATM、ALB、MAPK8和HSPA5).上关键基因均与肾小球滤过率(GFR)存在相关性,受试者工作特征(ROC)曲线提示其表达水平对DN均有诊断意义.RQ-PCR提示NFE2L2、PTEN、HSPA5 mRNA在高糖处理的HK-2细胞中显著上调,而TFRC mRNA水平显著下调.结论 TFRC、PTEN、NFE2L2和HSPA5可能在DN肾间质铁死亡中起关键作用,代谢反应可能是DN肾间质铁死亡的重要机制.
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