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香蕉冷胁迫相关MicroRNA差异表达分析

Expression Profiling of Cold-responsive MicroRNA in Banana

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研究香蕉miRNA在冷胁迫处理下的动态表达,初步探索miRNA在香蕉冷胁迫过程中的可能作用.利用茎环引物实时荧光RT-PCR(stem-loop qRT-PCR)策略,检测冷胁迫响应miRNA在5℃冷胁迫处理不同时间点香蕉幼苗叶片中的表达模式.结果表明,在检测的15个香蕉miRNAs中,不同的miRNA在同一冷胁迫时间下的表达量存在很大差异.根据其表达模式,可将15个miRNA分成4组.组1和组2中的12个miRNA(miR159e、miR159f、miR 160-3p、miR397a、miR399j、miR164e、miR444a、miR408、miR5179、miR530、miR535和miR5538),在5℃冷胁迫处理下表达量总体为上调,其在胁迫过程中的平均表达水平高于对照CK(0 h),说明冷胁迫诱导此类miRNA的表达.第3组包括miR 1561、miR162a和miR166a,其在5℃冷胁迫处理各时间点的表达量均低于对照,为下调表达,说明冷胁迫抑制此类miRNA的表达.第4组仅含1个miRNA,即miR156a,除在冷胁迫处理12h表达量明显上调外,其余时间点均下调表达.对这些miRNAs作用的靶基因进行预测和分析发现,它们主要参与植物的新陈代谢、信号传导和生长发育过程等.这为进一步验证与低温胁迫相关的目的miRNA的功能提供理论依据.

王静毅、刘菊华、金志强、徐碧玉

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中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口571101

中国热带农业科学院海口实验站/海南省香蕉遗传改良重点实验室,海口571101

香蕉 MicroRNA 实时荧光定量RT-PCR 表达分析

国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系中央级公益性科研院所基本科研业务费项目中央级公益性科研院所基本科研业务费项目

31501043CARS-3116300520170181630052016006

2019

中国农学通报
中国农学会

中国农学通报

CSTPCD
影响因子：0.891
ISSN：1000-6850
年,卷(期)：2019.35(5)
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