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RNA-seq揭示碱性盐(NaHCO3)对细叶百合鳞茎基因表达的影响

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本研究旨在揭示细叶百合在盐碱逆境中的基因表达表达情况,为合理利用盐碱地和大面积种植百合提供理论基础.以一年生的细叶百合鳞茎为材料,经过20 mmol/L NaHCO3处理24 h后,用Illumina HiSeqTM2000测序平台进行转录组测序.共测得56828个mRNA的注释信息,其中,55433个Unigene被注释到Nr数据库,26973条Unigene被注释到KOG数据库,23610条Unigene被注释到GO数据库,13142条Unigene被注释到KEGG数据库的五大类中.共鉴定出390个差异表达基因.选取了9个与盐碱胁迫密切相关的基因进行qPCR验证,9个基因的表达结果与转录组的结果基本趋于一致.通过细叶百合在碳酸盐(NaHCO3)逆境下的转录组对比数据,提供了许多的基因表达通路和表达量的差异,为合理利用盐碱地和大面积种植百合提供理论基础.
Salt-stress (NaHCO3)Revealed by RNA-seq: Effect on Gene Expression in Lilium pumilum Bulb

李冠嵘、何好、朱国庆、陈诗雅、徐阳、金淑梅

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东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室,东北林业大学生命科学学院,哈尔滨150040

细叶百合 鳞茎 NaHCO3 逆境 转录组 基因表达 表达量 qPCR

中央高校基本科研业务费专项资金资助黑龙江省自然科学基金联合引导项目

2572020DY18LH2019C011

2021

中国农学通报
中国农学会

中国农学通报

CSTPCD
影响因子：0.891
ISSN：1000-6850
年,卷(期)：2021.37(12)
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