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一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因分型及rpoE基因生物信息学分析

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为分析本实验室分离保存的一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因型和rpoE基因编码蛋白的生物特性,通过16S rDNA、特异性基因、荚膜分型、脂多糖分型、rpoE基因扩增等分子生物学和生物信息学方法对此株牦牛源多杀性巴氏杆菌进行分析.结果 表明:此株牦牛源多杀性巴氏杆菌为B∶ L2∶ST44基因型,rpoE基因和印度牛源多杀性巴氏杆菌rpoE基因相似性为100％,分子量22.0 ku,理论等电点4.86,属于不稳定、无跨膜结构、无信号肽、有保守结构域和有潜在磷酸化的胞内亲水性蛋白,二级结构α-螺旋占比最高67.02％,三级结构为棒状微弯曲模型,存在多个抗原表位,预测可与10个蛋白存在相互作用.综上,本研究对一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌进行基因分型和rpoE基因进行生物信息分析,为进一步了解西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因型和探索RpoE蛋白的生物学特性提供数据参考.
Genotyping and rpoE gene bioinformatics analysis of a Pasteurella multocida strain in Tibetan yaks

周赛赛、李天娇、武琦、朱家平、罗宗、吕然、赵晓慧、王一飞、罗润波、贡嘎、王保宁、索朗斯珠

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西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000

四川大学华西基础医学与法医学院,成都610041

牦牛 多杀性巴氏杆菌 基因分型 rpoE基因 生物信息学分析

国家肉牛牦牛产业体系项目西藏自治区科技厅2019年度重点项目

CARS-37

2021

10.11841/j.issn.1007-4333.2021.05.06

中国农业大学学报
中国农业大学

中国农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.971
ISSN：1009-508X
年,卷(期)：2021.26(5)
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