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一株牦牛源产细菌素植物乳杆菌SWUN5815全基因组测序及序列分析

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旨在分析一株牦牛源植物乳杆菌SWUN5815的全基因组序列测序,并对该菌株的功能特性基因进行挖掘.基于PacBio RSII测序平台对乳杆菌SWUN5815进行全基因组测序分析和GO、KEGG、COG和NR数据库进行基因组基本功能注释.结果 表明:1)植物乳杆菌SWUN5815的基因组大小为3.27 Mb,GC含量44.59％;2)预测到3 258个编码基因,编码基因总长度为2 814 147 bp,平均长度为864 bp;3)编码基因通过功能数据库对该菌株基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释得知,SWUN5815基因组中包括5个基因参与抗氧化活性过程,2个基因参与免疫过程;基因组中包含了抗生素、生物降解等代谢过程;可调控免疫和炎症的相关通路;基因组中含有18种已知细菌素基因;有4个合成ABC型细菌素转运系统的功能序列.综上,SWUN5815全基因组测序及分析挖掘其特异性功能基因有利于研究其益生特性提供基础,为菌株作为抗生素替代品的益生菌和饲料添加剂的应用研究提供了重要的参考数据.
Whole-genome sequencing and sequence analysis of a Lactobacillus plantarum SWUN5815 producing bacteriocin from yak

陈德纯、周晏阳、周泷、杨发龙、汤承

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西南民族大学畜牧兽医学院,成都610041

牦牛 植物乳杆菌 全基因组测序 基因功能注释 细菌素

中央高校基本科研业务费专项资金项目

2020 NQN31

2021

10.11841/j.issn.1007-4333.2021.05.07

中国农业大学学报
中国农业大学

中国农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.971
ISSN：1009-508X
年,卷(期)：2021.26(5)
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