首页|利用小RNA深度测序快速鉴定草莓病毒

利用小RNA深度测序快速鉴定草莓病毒

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
病毒侵染直接影响草莓的生长发育及果实品质,快速检测及鉴定病毒是病毒防治的前提.本研究以'丰香'草莓和'哈尼'草莓为试材,利用小RNA(sRNA)测序结合RT-PCR技术对2种栽培草莓品种中存在的病毒进行了研究.对sRNA测序结果进行组装和注释,结果表明:在混合样品中共有242个contigs比对到5种草莓病毒,分别为草莓白化病毒(strawberry pallidosis associated virus,SPaV)、草莓镶脉病毒(strawberry vein banding virus,SVBV)、草莓斑驳病毒(strawberry mottle virus,SMoV)、草莓毛形病毒3(strawberry crinivirus 3,SCrV 3)和草莓毛形病毒4(strawberry crinivirus 4,SCrV 4).利用RT-PCR技术对sRNA测序结果进行验证,结果表明:SMoV、SVBV和SCrV 3在'丰香'草莓和'哈尼'草莓中均检测到,而SPaV和SCrV 4只在'哈尼'草莓样品中检测到.本研究利用sRNA测序技术鉴定了2个草莓品种中存在的病毒,首次在我国生产的同一个草莓品种中检测到5种病毒,为草莓病毒的检测和防控提供了新的思路.
Rapid identification of strawberry viruses by small RNA deep sequencing

何成勇、高德航、范灵姣、邢飞、李世访、王红清

展开 >

中国农业大学园艺学院,北京100193

中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193

草莓 sRNA测序 草莓白化病毒 草莓毛形病毒 RT-PCR

2019YFD10018002017YFE0010900

2021

10.11841/j.issn.1007-4333.2021.08.06

中国农业大学学报
中国农业大学

中国农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.971
ISSN：1009-508X
年,卷(期)：2021.26(8)
  • 5
  • 12