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基于SLAF-BSA技术的蝴蝶兰花底色关联SNP分子标记开发与验证

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为筛选与蝴蝶兰花黄白底色相关的单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)位点,以'黄金豹'蝴蝶兰(♀)和'白天使'蝴蝶兰(♂)及其杂交后代为实验材料,选择33个分布在5个不同颜色分布类型组群中的黄色底色杂交后代和仅有的2个纯黄色个体作为黄色底色群体,35个分布在对应5个颜色分布类型组群中的白色底色杂交后代作为白色底色群体,分别提取DNA并等量混合后构建2个不同底色DNA混池,采用特异位点扩增片段测序(SLAF-seq)结合BSA技术,对与花底色密切相关的候选标记进行鉴定.结果 表明:共获得164874个SLAF标签,其中含21031个多态性SLAF标签,多态率为12.76％.SLAF标记在亲本中的平均序列深度为42×,在子代中的平均序列深度为46×.关联分析表明,在阈值＞0.7455时,筛选得到15个与花底色相关的SLAF候选标记,具27个SNP位点.采用SNaPshot测序技术在2个亲本、11个子代和4个不同的种质资源中验证SNP位点,筛选发现,Marker35886和Marker70907的2个SNP位点与相关SLAF序列中的SNP位点一致,对花底色的鉴定准确率分别为66.67％和73.33％,组合准确率达93.33％.本研究筛选到的2个SNP位点可作为有效的分子标记位点在蝴蝶兰育种早期进行辅助选择.
Identification and validation of single-nucleotide polymorphism markers linked to flower ground color in Phalaenopsis by using combined specific-locus amplified fragment sequencing and bulked segregant analysis

肖文芳、李佐、陈和明、吕复兵

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广东省农业科学院环境园艺研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室,广州510640

蝴蝶兰 底色 SLAF-BSA SNP

2018B0202020012020KJ121202127TD

2021

10.11841/j.issn.1007-4333.2021.09.10

中国农业大学学报
中国农业大学

中国农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.971
ISSN：1009-508X
年,卷(期)：2021.26(9)
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