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一株犬副流感病毒CPIV-BJ01株全基因组测序与其遗传变异分析

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为分析本实验室分离的犬副流感病毒CPIV-BJ01株全基因组序列与其遗传变异情况,对CPIV-BJ01株全长进行分段扩增并测序,拼接获得全基因组序列,与GenBank发布的27株副流感病毒5型分别进行全基因组和包膜糖蛋白(F、SH和HN)核苷酸及氨基酸序列的相似性比对,分析其遗传进化关系.结果 显示,CPIV-N01毒株与犬源PIV51168-1亲缘关系最近,核苷酸相似性为99.9％,氨基酸相似性为99.8％.CPIV-BJ01的F和HN基因序列变化较为保守,核苷酸和氨基酸变化均在4％以内,其中F蛋白的氨基酸变化形成一处新的O-糖基化位点;CPIV-BJ01株的SH基因序列与其他演化分支毒株差异显著,核苷酸相似性为84.4％～97.0％,氨基酸相似性为31.8％～95.6％.综上,CPIV-BJ01株基因组序列与前人报道的毒株相比,在F、HN基因和部分非编码区存在核苷酸或氨基酸序列的改变,同时F蛋白存在糖基化修饰的改变,均为该毒株所特有,该研究结果丰富了中国CPIV流行株的基因组信息.
Complete genome sequencing and genetic variation analysis of an isolated canine parainfluenza virus strain CPIV-BJ01

刘子宁、魏津、汤新明、梁琳、崔尚金

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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193

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犬副流感病毒 基因组测序 序列分析 包膜糖蛋白基因

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2021-YWF-ZYSQ-162017YFD05016032016YFD0501003ASTIP-IAS15

2021

10.11841/j.issn.1007-4333.2021.11.16

中国农业大学学报
中国农业大学

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CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.971
ISSN：1009-508X
年,卷(期)：2021.26(11)
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