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利用SSR标记构建板栗初级核心种质

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为科学利用现有板栗种质资源并对其进行高效管理和保存.本研究利用简单重复序列(SSR)标记,采用非加权算数平均聚类法(UPGMA)对来自12个省(市或自治区)的279份板栗种质进行多次聚类抽样.聚类抽样时将2种遗传相似系数(SM系数和Dice系数)和2种取样方法(随机取样法和位点优先取样法)分别组合获得不同样本群,再比较不同样本群的有效等位基因数(Ne)、Nei's多样性指数(H)和Shannon's信息指数(D,研究构建板栗初级核心种质的适宜方法,并采用t检验和主坐标分析评价初级核心种质的代表性,结合表型特征对其进行确认.结果 表明:应用位点优先取样法取得的种质比随机取样法具有更高的Ne、H和I;应用SM相似性系数构建的核心样本,其遗传多样性指标要优于Dice相似性系数;根据主坐标结合形态学指标分析,利用位点优先取样法和SM相似性系数经过3次聚类构建了68份板栗初级核心种质,保留了原种质24.37％的样品,Ne、H和I分别为1.539、0.329和0.502,均高于原种质各遗传多样性指标,能够较全面的代表整个板栗资源的遗传多样性.综上,基于SSR标记利用SM系数聚类,并结合位点优先取样法是构建板栗初级核心种质较适宜的方法.
Construction of primary core collection of Castanea mollissima BI.using SSR molecular markers

张馨方、张树航、李颖、郭燕、王广鹏

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河北省农林科学院昌黎果树研究所,河北昌黎066600

板栗 初级核心种质 SSR 遗传多样性

河北省农林科学院农业科技创新专项河北省农林科学院青年基金

2019-3-42018020106

2021

10.11841/j.issn.1007-4333.2021.12.09

中国农业大学学报
中国农业大学

中国农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.971
ISSN：1009-508X
年,卷(期)：2021.26(12)
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