首页|木兰科叶绿体基因组的密码子使用特征分析

木兰科叶绿体基因组的密码子使用特征分析

Codon Usage Profiling of Chloroplast Genome in Magnoliaceae

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 维普
  • 万方数据
木兰科植物是具有重要经济、药用和观赏等价值的原始被子植物,密码子是基因编码区蛋白翻译的核心元件,分析基因组编码区密码子的使用特征,对基因功能和系统进化研究具有重要意义.目前木兰科植物已有29个物种的叶绿体基因组被成功解析和注释.收集已有的木兰科植物叶绿体基因组,系统解析叶绿体基因组编码区的密码子使用特征,并阐释了木兰科植物间的亲缘进化关系.结果 表明,29种木兰科植物的叶绿体基因组编码区的同义密码子和最优密码子使用偏好相同,均以A/U结尾,自然选择是叶绿体编码区密码子偏好形成的主要原因.此外,基于29种木兰科植物叶绿体基因组、CDS序列以及密码子偏好特征RSCU值分别构建了系统进化树,分析发现,基于密码子偏好特征的物种间进化关系明显不同于前两者,而叶绿体基因组和CDS序列构建的进化关系更接近物种的真实分类,该结果也进一步支持了位点突变特征和非编码区序列在生物体的进化过程中往往具有重要的作用.

季凯凯、宋希强、陈春国、李革、谢尚潜

展开 >

海南大学,热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海南省热带特色花木资源生物学重点实验室,海口570228

大卫集团大卫(海南)股份发展有限公司,海口570228

木兰科 叶绿体基因组 密码子使用 系统进化树

国家自然科学基金海南大学科研启动基金海南省自然科学基金创新团队项目

31760316和31600667KYQDZR 17212018CXTD331

2020

10.13304/j.nykjdb.2019.0937

中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.252
ISSN：1008-0864
年,卷(期)：2020.22(11)
  • 26
  • 13