中国农业科技导报2021,Vol.23Issue(2) :73-80.DOI:10.13304/j.nykjdb.2019.0860

高通量测序分析蚕豆种子内生细菌的多样性

Diversity of Endophytic Bacteria in Faba Bean Seeds by High-Throughput Sequencing

刘璐 名晓东 张晓艳 郝俊杰 付丽平 王乾坤 吕鑫 陈旺 刘全兰
中国农业科技导报2021,Vol.23Issue(2) :73-80.DOI:10.13304/j.nykjdb.2019.0860

高通量测序分析蚕豆种子内生细菌的多样性

Diversity of Endophytic Bacteria in Faba Bean Seeds by High-Throughput Sequencing

刘璐 1名晓东 1张晓艳 2郝俊杰 2付丽平 1王乾坤 1吕鑫 1陈旺 1刘全兰1
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作者信息

  • 1. 青岛科技大学海洋科学与生物工程学院,山东青岛266042
  • 2. 青岛市农业科学研究院,山东青岛266100
  • 折叠

摘要

为了分析蚕豆种子内生细菌的多样性,采用Illumina MiSeq高通量测序技术,从日本大白皮(S18P23.1、S18P23.2)和启豆2号(S18P24.1、S18P24.2)的种子获得16S RNA V3~V4区有效序列133 855条.将高于97%相似度的序列划分为一个操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU),优化后得到1 598个OTUs.内生细菌种群分析结果表明,拟杆菌门(Bacteroidetes,丰度为30%~33%)、变形菌门(Proteobacteria,23%~25%)、厚壁菌门(Firmicutes,23%~25%)和放线菌门(Actinobacteria,5%~7%)为两个蚕豆品种共有的优势菌门,但属水平的优势菌群在供试蚕豆种子中均有差异.这些结果表明,蚕豆种子具有丰富的内生细菌资源,含有多种具有益功能性状的细菌类群,值得进一步跟踪研究这些益生菌在蚕豆种植到土壤后的变化规律;启豆2号种子中益生菌的种类和丰度高于日本大白皮,值得进一步分离和研究这些益生菌的益生或促生特性,筛选获得在食品和生物肥料等领域有应用潜力的菌株.

关键词

高通量测序/蚕豆/内生细菌/多样性

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基金项目

国家食用豆产业技术体系项目(CARS-08)

青岛市农业科学研究院院长基金()

出版年

2021
中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.252
ISSN:1008-0864
被引量2
参考文献量12
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