中国农业科技导报2021，Vol.23Issue(3) ：51-57.DOI:10.13304/j.nykjdb.2019.0805

高通量测序鉴定中间锦鸡儿干旱条件下的microRNA

Identification of microRNAs in Caragana intermedia Kuang by High Throughput Sequencing Under Drought Stress

苏雨萌 张旭婷 特日格乐 田敏 尚晓蕊 李国婧 王瑞刚
中国农业科技导报2021，Vol.23Issue(3) ：51-57.DOI:10.13304/j.nykjdb.2019.0805
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高通量测序鉴定中间锦鸡儿干旱条件下的microRNA

Identification of microRNAs in Caragana intermedia Kuang by High Throughput Sequencing Under Drought Stress

苏雨萌 1张旭婷 1特日格乐 1田敏 1尚晓蕊 1李国婧 1王瑞刚1
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作者信息

  • 1. 内蒙古农业大学生命科学学院,植物逆境生理与分子生物学自治区重点实验室,呼和浩特010018
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摘要

中间锦鸡儿分布于干旱和半干旱地区,适应干旱和高温逆境环境,被广泛应用于固沙和水土保持,具有很高的生态价值.microRNA是一类非编码RNA,广泛分布于植物体内,参与干旱、盐、低温等多种胁迫响应.为了鉴定中间锦鸡儿中抗旱相关的miRNA,构建了干旱条件的small RNA文库,通过高通量测序和生物信息学分析,共鉴定得到116个miRNA,88个保守的miRNA属于33个已知miRNA家族和28个新miRNA,差异表达的miRNA中,cin-miR164a、cin-miR164b、cin-miR168a、cin-miR168b在三个干旱处理时间下调表达,cin-novel-3、cin-novel-1l、cin-novel-21在干旱处理1和3h上调表达,cin-novel-26在干旱处理3h特异表达;28个新miRNA通过psRNATarget在中间锦鸡儿中预测到582个靶基因,在拟南芥中预测到212个靶基因,大多数靶基因参与干旱胁迫响应.这些为后续研究中间锦鸡儿miRNA响应干旱胁迫奠定了基础.

关键词

中间锦鸡儿/干旱胁迫/microRNA/高通量测序/靶基因预测

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基金项目

国家自然科学基金(31760696)

内蒙古自治区科技创新引导奖励资金项目(KCBJ2018012)

出版年

2021
中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.252
ISSN：1008-0864
参考文献量1
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