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水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析

Global Small RNA Transcriptome Profiling of Rice Under Drought Stress

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small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用.然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘.对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序.所有样品共检测到403个miRNAs,其中已知miRNAs 352个,新预测miRNAs 51个.干旱处理后24 h的根、茎和叶中分别有37、35和56个差异表达miRNAs,而96 h的根、茎和叶中分别有35、62和65个差异表达miRNAs.15个miRNAs在干旱处理后两个时间点的根、茎和叶中均差异表达,其中,Osa-miR159f、Osa-miR164f、Osa-miR5082和Osa-miR5493受干旱诱导上调表达,是干旱响应中关键调控因子.预测到miRNAs靶基因4 537个,并进行了功能注释和富集分析.这些结果为鉴定干旱响应miRNAs并解析其参与抗旱的分子调控机理提供了理论和数据资源.

刘源、张秀妍、徐妙云、郑红艳、邹俊杰、张兰、王磊

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中国农业科学院生物技术研究所,北京100081

水稻 干旱胁迫 small RNA 转录组 已知miRNA 新miRNA 靶基因

国家转基因生物新品种培育科技重大专项国家自然科学基金

2018ZX0801103B31801283

2021

10.13304/j.nykjdb.2019.1079

中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.252
ISSN：1008-0864
年,卷(期)：2021.23(6)
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