摘要
NAC蛋白是植物特有的转录因子,在植物发育和各种非生物逆境应答中发挥着重要作用.为更好地揭示玉米SNAC(stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2)家族的耐逆境胁迫功能,对其基因的结构特征及可能的调控机理进行了预测.利用生物信息学方法,鉴定了玉米16个SNAC家族基因,并对该基因家族各编码蛋白的理化性质、基因结构、潜在的磷酸化位点、蛋白质二级结构、基因进化关系、基因组序列结构和启动子结合元件等信息进行分析.分析结果表明:玉米16个SNACs不具有跨膜结构,且均具有N-末端保守结构域和高度可变的C-末端结构域.系统发育分析表明,同—亚群中密切相关的成员具有相似的基因结构,推测在不同植物中会具有类似的耐逆功能.磷酸化位点分析表明,玉米SNAC家族存在着大量的磷酸化位点.二级结构预测表明,玉米SNAC的转录调控区具有高度的内在灵活性.启动子分析表明,玉米SNAC家族基因启动子区域均含有大量的逆境胁迫应答顺式作用元件.这些结果为玉米耐逆境研究提供了候选基因,对促进玉米SNAC家族功能分析的进展具有重要意义.
基金项目
国家自然科学基金国际合作项目(31661143010)
国家重点研发计划(2016YFD0101803)
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