中国农业科技导报2021,Vol.23Issue(12) :66-75.DOI:10.13304/j.nykjdb.2020.0618

甘草PRR基因家族鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of PRR Gene Family in Glycyrrhiza uralensis

关思静 王楠 徐蓉蓉 葛甜甜 高静 颜永刚 张岗 陈莹 张明英
中国农业科技导报2021,Vol.23Issue(12) :66-75.DOI:10.13304/j.nykjdb.2020.0618

甘草PRR基因家族鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of PRR Gene Family in Glycyrrhiza uralensis

关思静 1王楠 2徐蓉蓉 1葛甜甜 1高静 1颜永刚 1张岗 1陈莹 1张明英1
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作者信息

  • 1. 陕西中医药大学药学院,陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心,西安712046
  • 2. 陕西中医药大学,陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心,陕西咸阳712083
  • 折叠

摘要

伪应答调控(PRR)蛋白作为植物生物钟中央振荡器的重要组成部分,参与植物昼夜节律的调节,在植物生长发育、逆境胁迫响应等生命活动中发挥重要作用.利用生物信息学方法鉴定了甘草PRR蛋白编码基因,并结合转录组数据分析其在盐胁迫、干旱胁迫和低磷胁迫下的表达模式.结果 表明:甘草基因组中共鉴定出7个GuPRR基因;根据系统发育进化分析将甘草PRR蛋白分为3个分支.在GuPRR启动子区还发现了大量的低温、干旱、光、茉莉酸甲酯、脱落酸和水杨酸响应的顺式元件.转录组数据分析结果表明,7个GuPRR基因在不同的组织都存在表达且响应不同的非生物胁迫.这些结果为甘草PRR基因家族的研究提供了理论的基础资料,将有助于深入了解甘草PRR基因家族的功能.

关键词

甘草/PRR基因家族/生物信息学分析/基因表达

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基金项目

国家自然科学基金(31600320)

陕西省社会发展科技攻关项目(2018SF-338)

陕西省高校科协人才托举项目(20170208)

陕西中医药大学"秦药"品质评价及资源开发学科创新团队项目(2019-QN01)

出版年

2021
中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.252
ISSN:1008-0864
被引量1
参考文献量4
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