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陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证

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为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花.结果 表明,GhPKE1基因序列全长1048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56.分别用硫酸钠(Na2SO4)和氯化镉(CdCl2)胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异.qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na2SO4和抗CdCl2性显著减弱.综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础.
Bioinformatics Analysis and Functional Verification of GhPKE1 in Upland Cotton

王琴琴、陈修贵、陆许可、王帅、张悦新、范亚朋、陈全家、叶武威

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新疆农业大学农学院,教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐830052

中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,河南安阳455000

陆地棉 GhPKE1 生物信息学分析 VIGS

国家重点研发计划

2016ZX08005004-005

2022

10.13304/j.nykjdb.2020.1054

中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.252
ISSN：1008-0864
年,卷(期)：2022.24(1)
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