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高通量技术分析'砂蜜豆'甜樱桃不同组织内生细菌多样性

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为探明甜樱桃内生细菌种群结构及多样性,以'砂蜜豆'甜樱桃根、主干树皮和枝条3个组织的内生细菌为研究对象,对其16S rRNA V3~V4区进行高通量测序。结果表明,'砂蜜豆'甜樱桃不同组织内生细菌群落多样性及功能存在较大差异。不同组织中共获得有效序列9665813条,聚类为1386个OTU(operational taxonomic units),隶属于20个门、43个纲、79个目、162个科和346个属。在门水平,变形菌门(Proteobacteria)在各组织中的丰度均最高,是最优势菌门。在属水平,根部内生细菌的优势菌属为链霉菌属(Streptomyces)、类固醇杆菌属(Steroidobacter)和乳酸杆菌属(Lactobacillus);枝条内生细菌中鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas)的相对丰度较高;主干树皮内生细菌的优势菌属为拟杆菌属(Bacteroides)。PICRUSt(phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states)基因预测表明,内生细菌功能主要涉及多糖、萜类和酮类、酶及维生素等次生代谢产物的生物合成。综上所述,甜樱桃内生细菌具有丰富的种群多样性,为今后开发利用甜樱桃内生细菌资源奠定了基础。
Diversity Analysis of Endophytic Bacterial Community in Different Tissues of'Summit'Sweet Cherry Using High-throughput Sequencing

赵柏霞、闫建芳

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大连市农业科学研究院,辽宁 大连 116036

大连民族大学生命科学学院,辽宁 大连 116600

甜樱桃 内生细菌 种群多样性 不同组织 高通量测序

辽宁省自然科学基金大连市科技创新基金大连民族大学2020年博士启动项目

2021-MS-3742020JJ27SN110

2023

中国农业科技导报
中国农村技术开发中心

中国农业科技导报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.252
ISSN:1008-0864
年,卷(期):2023.25(3)
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