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中国玉米品种及其亲本系谱数据库的创建与利用

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[目的]新品种的选育与推广是促进中国玉米产量不断提高的重要因素,而优良自交系的选育是组配强优势杂交组合的前提.明确不同自交系的亲缘与系谱关系是玉米自交系改良、杂种优势类群划分和杂交组合组配的重要依据.为破解中国玉米自交系血缘关系不明确、查询不方便的现状,迫切需要对现有品种的系谱进行全面梳理,并构建相应的系谱数据库.[方法]基于LNMP(Linux平台+Nginx服务器软件+MySQL数据库管理系统+PHP超文本预处理软件)服务器环境配置设计MySQL数据库;搜集和整理中华人民共和国农业农村部、各省农业农村厅、中国种业大数据平台等网站及玉米品种系谱相关文献及书本中自交系信息及历年玉米品种审定信息,并导入MySQL数据库;利用织梦内容管理系统(DedeCMS)管理和更新MySQL数据库;通过AJAX(Asynchronous Javascript and XML)异步请求方式提交查询请求并经PHP处理后将提取的自交系及品种信息进行处理,最终以详细信息及系谱树的形式返回网页前端,创建了中国玉米品种及其亲本系谱数据库(https://www.maizedata.cn);此外,使用phpMyAdmin软件对数据库结构进行后期优化及新功能添加.[结果]数据库收录了中国不同年代选育的玉米自交系、省级以上审定品种信息10000余条,涉及自交系1218个,杂交种7823个,每个杂交种因审定编号不同,收录的品种信息从1至10条不等.此外,还添加了玉米自交系及品种系谱信息的增加、修改和删除等功能.[结论]基于LNMP服务器环境配置,创建了中国玉米品种及其亲本系谱数据库,收录自交系及品种信息10000余条,涉及自交系1218个,杂交种7823个.该数据库实现了品种信息检索、系谱追溯、子代查询、定制化查询、用户上传及纠错系谱信息等功能,便于中国玉米育种家及科研工作者快捷查询玉米自交系及品种的信息及系谱关系.
Construction and Utilization of Database for Chinese Maize Varieties and Their Genealogy

李建新、席蒙慧、张嘉玮、席蒙娟、田丁、鲁懿哲、陈晓阳、李卫华、张雪海、汤继华

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河南农业大学农学院/省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室,郑州450002

南阳师范学院化学与制药工程学院,河南南阳473061

新乡医学院管理学院,河南新乡450003

郑州工程技术学院中德学院,郑州450000

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玉米 自交系 品种 系谱 数据库

河南省科技攻关项目河南省科技攻关项目河南省高等学校重点科研项目河南农业大学科技创新基金2016年度河南省高等学校青年骨干教师培养计划郑州市重大科技创新专项

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2020

中国农业科学
中国农业科学院

中国农业科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.899
ISSN:0578-1752
年,卷(期):2020.53(16)
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