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189份桃种质肉质性状形成相关位点基因型鉴定及组合分析

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[目的]通过分子标记与生物信息学手段,鉴定189份桃种质与肉质形成相关的F-M基因座、YUC11启动子区转座子插入、NAC72编码区9 bp插入的基因型及3个位点组合情况,为深入研究桃果实肉质形成机制及育种亲本选配提供理论基础.[方法]通过PCR扩增、竞争性等位基因特异PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP)、高分辨率溶解曲线(high resolution melting analysis,HRM)技术,对F-M基因座倍型、YUC11转座子插入、NAC72 9 bp插入进行检测;同时结合重测序数据利用生物信息学方法进一步验证,从而准确鉴定189份桃种质肉质性状形成相关位点基因型及组合情况.[结果]F-M基因座编码多聚半乳糖醛酸酶(endo-PG)的PGM与PGF是调控桃果实肉质形成的两个重要基因.189份桃种质中,PGM与PGF分别有159份(84％)、99份(52％).F-M基因座共发现H0、H1、H2、H3 4种单倍型,占比分别为33％、39％、4％、24％.在F-M基因座,不溶质粘核以H13H3、H2H3组合为主,溶质粘核以H0H0、H0H1组合为主,溶质离核以H1H1、H0H1组合为主.发现18份含有硬质基因型的种质,在YUC11启动子区含有转座子纯合插入.HRM结果表明,NAC72编码区9 bp插入纯合(早熟)有45份种质、插入杂合(中熟)有71份种质、无插入(晚熟)有73份种质,中熟与晚熟种质占比77％;其中6份种质基因型与表型差别较大.不溶质粘核、溶质粘核、溶质离核3种常见肉质类型,在3个位点最多的基因型组合分别是mmffHdHdI、MMffHdHdI、MMFFHdHdL.[结论]通过分子试验与生物信息学相结合进一步证实了 F-M基因座存在4种单倍型;发现18份含有硬质基因型的种质;开发了一种用于鉴定桃成熟期的分子标记;鉴定出不同种质在肉质相关位点的基因型组合形式.
Genotype Identification and Combination Analysis of Loci Related to the Peach Flesh Texture Trait via 189 Peach Accessions

peachflesh texturegenotype identificationgenotype combinations

王朝晖、李勇、曹珂、朱更瑞、方伟超、陈昌文、王新卫、吴金龙、王力荣

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中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009

桃 肉质 基因型鉴定 基因型组合

国家桃产业技术体系建设项目中国农科院创新工程项目

CARS-30-1-04CAAS-ASTIP-2022-ZFRI-01

2023

10.3864/j.issn.0578-1752.2023.12.011

中国农业科学
中国农业科学院

中国农业科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.899
ISSN：0578-1752
年,卷(期)：2023.56(12)
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