[目的]高产是小麦育种的永恒主题,利用全基因组关联分析发掘控制小麦产量性状的QTL区段及优异基因,为小麦分子标记辅助选择育种提供理论依据和标记信息.[方法]以新疆本地 188 个冬小麦品种资源为材料,利用小麦 55K SNP芯片进行全基因组扫描,通过对6个不同环境下的株高、穗长、小穗数、可育小穗数、穗粒数、千粒重、粒长、粒宽、籽粒长/宽比 9 个产量相关性状进行表型鉴定,利用 6 个环境下各性状数据及最佳线性无偏预测(BLUP)数据,基于混合线性模型(MLM)对表型和基因型进行全基因组关联分析.[结果]经主成分分析,将188个材料分为地方品种和育成品种2个亚群;利用6个环境下各性状数据,9个性状共检测到1 309个显著性SNP标记,其中,每个显著性SNP位点可解释7.259%—70.792%的表型变异.利用BLUP数据,9个性状共检测到66个显著性位点,同时与2个性状关联的共有SNP位点有5个,贡献率波动范围为 8.498%—21.877%.将同时与 2 个性状或 2 个以上环境关联到的重复位点作为稳定的显著性关联位点,9 个性状共检测到 38 个稳定关联位点,包括株高重复位点 5 个,穗长重复位点 10 个,小穗数重复位点 10 个,结实小穗数重复位点 6个,穗粒数重复位点 6 个,千粒重重复位点 1 个,可解释 9.10%—23.81%的表型变异.将这 38 个位点与已发布小麦基因组位点比对,仅找到 3 个与本研究关联重复位点位置相近、且有注释基因功能的基因,分别是:2A染色体上与株高关联位点AX-108794050 距离相近的 TraesCS2A01G448800,与转录因子 bHLH71 的代谢合成有关;1A 染色体上与穗长关联位点AX-110689765 距离相近的TraesCS2A01G448800,与蛋白质编码有关;4B染色体上与千粒重关联位点AX-110399975 距离相近的TraesCS4B01G031100,与编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD1-8 有关,参与对细胞增殖与分化的调控.[结论]检测到 38个与小麦产量性状关联的QTL位点,关联的优良等位基因具有降低株高、增加穗长、小穗数、可育小穗数、穗粒数和千粒重的作用.
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