中国全科医学2023,Vol.26Issue(20) :2496-2502.DOI:10.12114/j.issn.1007-9572.2022.0832

基于16S rDNA测序探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群特征

16S rDNA Sequence Analysis of the Characteristics of Gut Flora in Patients with Esophageal Squamous Cell Carcinoma

张玉双 孔令洋 管佳畅 李建波 王一然 王瑜 李晶
中国全科医学2023,Vol.26Issue(20) :2496-2502.DOI:10.12114/j.issn.1007-9572.2022.0832

基于16S rDNA测序探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群特征

16S rDNA Sequence Analysis of the Characteristics of Gut Flora in Patients with Esophageal Squamous Cell Carcinoma

张玉双 1孔令洋 2管佳畅 1李建波 1王一然 2王瑜 2李晶3
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作者信息

  • 1. 050011 河北省石家庄市,河北医科大学第四医院中医科
  • 2. 050011 河北省石家庄市,河北医科大学中西医结合学院
  • 3. 050011 河北省石家庄市,河北医科大学第四医院中医科;050011 河北省石家庄市,河北医科大学中西医结合学院
  • 折叠

摘要

背景 食管癌是我国的高发肿瘤之一,其发病与死亡人数均为世界平均水平的2倍以上.在我国大多数食管癌发现时已是中晚期,预后较差,所以迫切需要早期诊断及干预治疗,目前肠道菌群在食管癌诊断及治疗中的作用备受关注.目的 探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群基本特征.方法 纳入2022年4—8月就诊于河北医科大学第四医院未经任何抗肿瘤治疗的食管鳞状细胞癌患者35例作为食管癌组,健康志愿者35例作为对照组.收集两组人群粪便标本,应用16S rDNA技术检测肠道菌群,根据检测结果物种注释情况分析两组人群肠道菌群的Alpha多样性、Beta多样性〔主坐标分析(PCoA)〕及菌群物种差异性〔线性判别分析及影响因子(LEfSe)分析〕.结果 两组人群肠道菌群Alpha多样性香农(Shannon)、辛普森(Simpson)、Chao1、ACE及Goods_coverage指数比较均无明显差异(P>0.05);而PCoA图显示两组样本整体上相距较远,群落结构存在差异(t=10.837,P<0.001).两组人群肠道菌群T-test检验结果在属水平共有16类菌属的丰度存在明显差异,相对丰度较高的前8位菌属中,食管癌组栖粪杆菌属(Faecalibacterium)、罗斯氏菌属(Roseburia)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)丰度低于对照组,乳杆菌属(Lactobacillus)、罗姆布茨菌属(Romboutsia)、瘤胃球菌属组(Ruminococcus_torques_group)、肠杆菌属(Intestinibacter)、土杆菌属(Turicibacter)丰度高于对照组(P<0.05).LEfSe分析结果显示14种肠菌丰度存在差异,在属及种水平上与对照组相比,食管癌组Faeculibacterium及普拉梭菌(Faecalibacterium-prausnitzii)丰度降低,Romboutsia及Rombutsia-ilealis丰度升高(P<0.05).结论 食管鳞状细胞癌患者具有显著性差异肠菌,其中Faecalibacterium、Faecalibacterium-prausnitzii、Romboutsia及Rombutsia-ilealis可能是食管癌特异性改变物种,与食管癌发生密切相关.

关键词

食管肿瘤/食管鳞状细胞癌/肠道菌群/16S/rDNA测序/Alpha多样性/Beta多样性/LEfSe分析

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基金项目

国家自然科学基金资助项目(81973761)

河北省重点研发计划项目(223777122D)

出版年

2023
中国全科医学
中国医院协会

中国全科医学

CSTPCD北大核心
影响因子:2.04
ISSN:1007-9572
参考文献量6
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