首页|大别班达病毒的遗传进化机制研究

大别班达病毒的遗传进化机制研究

扫码查看
原文链接
  • 万方数据
  • 维普
目的 阐明大别班达病毒(Dabie bandavirus,DBV)的基因型流行分布特征,探究DBV进化机制的动态变化,为DBV的预防控制提供科学依据.方法 使用Iqtree软件以最大似然法构建DBV的L、M、S片段系统发育进化树并进行遗传进化关系的分析;以系统发育进化树为参考,筛选重配株;使用RDP4软件进行DBV重组情况的检测;DBV序列的遗传距离以及选择压力分析由Mega11.0软件计算.结果 重组分析显示共88株毒株出现重组现象,潜在重组事件共计98个.L、M、S片段的重组率分别为3.48％、2.88％、1.75％.重组事件在非人类宿主中检测到的比例相较之前的研究有所上升.经重配分析,在148株重配株中发现了36种重配基因型,未报道过的重配基因型有16种.本研究检测到24株同时发生重组和重配的基因组序列.dN/dS的结果表明,RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)、糖蛋白(GP)、核蛋白(NP)和非结构蛋白(NSs)进化过程中可能主要受负选择压力影响.结论 越来越多的动物宿主如狗、猫、牛等参与DBV的重组、重配事件中,使其进化机制更趋复杂,这对DBV疫苗的设计和SFTS的预防带来了更大的挑战.
Investigation of the genetic evolutionary mechanisms of Dabie bandavirus

Dabie bandavirus(DBV)recombinationreassortmentselection pressureevolution

张宇涵、李超、王玉昊、韦雪敏、许一菲

展开 >

山东大学齐鲁医学院公共卫生学院微生物检验学系,济南 250012

山东大学苏州研究院,苏州 215123

DBV 重组 重配 选择压力 进化

山东省优秀青年科学基金(海外)江苏省自然科学基金青年基金

2022HWYQ-056BK20220270

2024

10.3969/j.issn.1002-2694.2024.00.027

中国人兽共患病学报
中国微生物学会

中国人兽共患病学报

CSTPCD北大核心
影响因子：0.814
ISSN：1002-2694
年,卷(期)：2024.40(2)
  • 30