摘要
目的 阐明大别班达病毒(Dabie bandavirus,DBV)的基因型流行分布特征,探究DBV进化机制的动态变化,为DBV的预防控制提供科学依据.方法 使用Iqtree软件以最大似然法构建DBV的L、M、S片段系统发育进化树并进行遗传进化关系的分析;以系统发育进化树为参考,筛选重配株;使用RDP4软件进行DBV重组情况的检测;DBV序列的遗传距离以及选择压力分析由Mega11.0软件计算.结果 重组分析显示共88株毒株出现重组现象,潜在重组事件共计98个.L、M、S片段的重组率分别为3.48％、2.88％、1.75％.重组事件在非人类宿主中检测到的比例相较之前的研究有所上升.经重配分析,在148株重配株中发现了36种重配基因型,未报道过的重配基因型有16种.本研究检测到24株同时发生重组和重配的基因组序列.dN/dS的结果表明,RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)、糖蛋白(GP)、核蛋白(NP)和非结构蛋白(NSs)进化过程中可能主要受负选择压力影响.结论 越来越多的动物宿主如狗、猫、牛等参与DBV的重组、重配事件中,使其进化机制更趋复杂,这对DBV疫苗的设计和SFTS的预防带来了更大的挑战.
基金项目
山东省优秀青年科学基金(海外)(2022HWYQ-056)
江苏省自然科学基金青年基金(BK20220270)
维普
万方数据